本发明公开了麦洼牦牛特异性基因、引物组及应用，以解决现有技术中尚未有利用麦洼牦牛特有基因组进行麦洼牦牛品种鉴别、分子育种的问题。本发明的麦洼牦牛特异性基因，包括如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。本发明引物组包括上引物和下引物，其核苷酸序列分别为：GAGCCCTGAGAACTATCGTGACTT；ATTGGACTCCTGGCGACTTTT。本发明所述的麦洼牦牛特异性基因在鉴别麦洼牦牛品种、分子育种上的应用。利用本发明的特异性基因及引物组，可以从基因水平上进行麦洼牦牛的品种鉴别及分子育种，对于优质牦牛基因资源的保护、优质牦牛资源育种、牦牛近郊品系的亲缘关系鉴定起到极大的推动作用。
本发明公开了提供牦牛全基因组的16个SNP位点在牦牛表型性状或分子育种分析中的应用，解决了现有技术中尚未有采用SNP位点对牦牛表型性状或分子育种分析的问题。本发明的16个SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑16所示。本发明还公开了用于检测该16个SNP位点的引物组及包括该引物组的试剂盒。本发明又公开了牦牛表型性状或分子育种分析的方法。本发明的16个SNP位点可为育种上下游过程提供支持，具有测定准确率高、易实现标准化和自动化检测等诸多优势。
