本发明提供一种脱卤素酶基因LinB、脱卤素酶、脱卤素酶基因工程菌及其构建方法和应用方法。其中,脱卤素酶基因LinB包括(a)SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列;(b)编码SEQ ID NO.2所示氨基酸序列的核苷酸序列;或(c),(a)或(b)的变异体。脱卤素酶包括SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列编码的多肽;SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列;或其变异体。脱卤素酶基因工程菌的构建方法包括将脱卤素酶基因LinB克隆入重组表达载体,导入宿主细胞,获得能够表达脱卤素酶的脱卤素酶基因工程菌。