本发明涉及一种鉴别肉鸡黄皮肤性状的SNP分子标记及其在检测鸡黄色皮肤性状上的应用，所述分子标记位于鸡基因组的24号染色体上，核苷酸序列如SEQ 1所示；所述分子标记位于第‑104位点，突变碱基为C或G。应用包括以下步骤：步骤1）、提取鸡的基因组DNA；步骤2）、针对BCO2(G‑104C)设计特异性扩增引物BCO2‑F1和BCO2‑R1，再以步骤1）的DNA为模板进行PCR扩增反应，获得PCR产物；其中，BCO2‑F1序列如SEQ ID NO.2，BCO2‑R1序列如SEQ ID NO.3；步骤3）、将步骤2）得到的PCR产物进行基因序列测序，通过基因测序序列和峰图判定鸡肤色基因型。通过本发明，为有目的地对鸡黄皮肤性状进行选择提供科学依据，通过检测可完成育种群在目标鸡黄皮肤上的纯化。
