本发明属于植物基因工程领域,具体涉及菜心耐热调控基因及其应用,所述菜心耐热调控基因为减数分裂相关基因BrASY2和天冬氨酸激酶基因BrAK3。所述BrASY2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述BrAK3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明公开的BrASY2基因和BrAK3基因在调控菜心耐热性方面具有非常重要的作用,能够有效调节菜心对高温的耐受力,可应用于调控菜心耐热性,本发明为研究植物应答高温信号的机制奠定理论基础,也为培育耐热菜心新品种提供了基因资源,具有较好的潜在应用价值。