本发明属于生物技术领域，具体涉及小麦低亲和性硝态盐转运蛋白基因TaNPF7.6‑1A的KASP标记及其应用。本发明发现以中国春参考基因组Chinese Spring v1.0为准，chr1A:355628042处存在位点多态性，SNP为T/G，该位点可作为小麦低亲和性硝态盐转运蛋白基因的分子标记。本发明基于该基因序列信息开发了检测该基因存在的SNP多态性的KASP分子标记，该KASP标记特异引物可以将氮效率差异的种质进行良好分型，实现氮高效种质的分子标记辅助育种，具有良好的应用价值。
本发明公开了一个与小麦籽粒硬度性状相关的分子标记5668，以及一组与该分子标记相关的KASP引物组及其应用，所述KASP引物组包括：核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的上游引物1，核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的上游引物2，核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的下游引物3，其中引物3为共用引物；以该KASP引物组为引物，以待测小麦基因组为模板进行PCR扩增，当小麦两条染色体对应位点碱基均为C时，小麦籽粒属于高硬度籽粒表型的CC基因型小麦品种，当小麦两条染色体对应位点碱基均为T时，小麦籽粒属于低硬度籽粒表型的TT基因型小麦品种。
本发明属于生物技术领域，具体涉及一种小麦穗发芽抗性数量性状位点QSS.TAF9‑3D相关的SNP标记、KASP检测引物及其应用。所述SNP标记位于小麦穗发芽主效QTL QSS.TAF9‑3D中、SEQ ID NO:8所示的序列的第20个碱基处，该处的碱基为T/C。本发明对中国河南629份小麦种质进行扩增分析，KASP标记结果显示可将629份自然群体分为两种单倍型，分别将其命名为QSS.TAF9‑3D‑TT单倍型（抗穗发芽）与QSS.TAF9‑3D‑CC单倍型（感穗发芽），说明其在小麦抗穗发芽分子辅助育种中是可用的。
