本发明公开了陆地棉D12号染色体与耐盐关联的SNP分子标记及其应用，涉及植物分子生物学领域。该SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑12中任一项所示。本发明提供的与棉花植株耐盐关联的SNP分子标记，直接以DNA的形式表现，在棉花的各个组织和发育阶段均可检测，不受环境和季节限制，不存在表达与否等问题影响，不用分析片段的长度，适于快速、规模化、自动化筛查。该SNP分子标记可用于鉴别陆地棉耐盐性状，实现对陆地棉植株耐盐能力的早期预测，还可用于棉花耐盐相关遗传背景分析和筛选，以及植株耐盐位点分子标记辅助选择育种，具有广阔的应用前景。
本发明公开了一种改良棉花纤维长度的蛋白及其应用，属于植物学领域。所述蛋白包括氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的GhARF2蛋白、氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示的GhGASA4蛋白和氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示的GhGASA24蛋白的一种或任意组合。本发明通过分子生物学实验、植物组织培养技术等研究GhARF2、GhGASA4和GhGASA24基因在棉纤维发育中的功能，证明了上述基因过表达能够显著促进纤维发育，在纤维发育中发挥重要的作用，为棉纤维发育提供理论基础，有效拓宽棉花育种基因资源，为棉花育种提供优质的种质资源。
本发明提供与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域。本发明与陆地棉植株绒毛相关的SNP标记共31个，这些标记具有SEQ ID No.1～SEQ ID No.31所示的DNA序列，这些SNP分子标记单独或任两个或多个组合应用均可用于陆地棉植株绒毛的早期预测，还可用于棉花遗传背景分析和筛选，以及植株绒毛位点分子标记辅助选择育种，具有广阔的应用前景。
本发明公开了陆地棉纤维伸长率相关的单体型中D01上SNP分子标记及其应用，所述分子标记如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.46之一所示；其导致纤维伸长率出现多态性。本发明提供的与陆地棉纤维伸长率相关的SNP分子标记可以用于棉花纤维伸长率性状的早期预测和筛选，还可以用于棉纤维伸长率分子标记辅助育种。本方法主要通过直接检测DNA，在棉花的各个组织、各个发育阶段均可应用，不受季节、环境限制、不存在表达与否等问题。
本发明属于棉花分子生物学、基因工程技术领域，尤其涉及一种控制亚洲棉光籽性状基因及其编码的蛋白质以及应用，所述基因命名为GaFZ，该基因仅有一个外显子无内含子，长度为264 bp，所述基因和编码蛋白的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示，通过解析该基因的分子生物学功能，探究其对表皮毛和棉纤维发育的分子机制，进而利用该基因提高棉纤维产量，培育环境友好型棉花品种。
本发明公开与陆地棉纤维强度一般配合力相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于SEQ ID No.1～SEQ ID No.146任一所示核苷酸序列的第50位核苷酸。本发明提供的与陆地棉纤维强度一般配合力相关的SNP分子标记可以用于陆地棉纤维强度一般配合力的早期预测和筛选，还可以用于纤维强度一般配合力的分子标记辅助育种。其直接以DNA的形式表现，不存在表达与否等问题。在陆地棉的各个组织、各个发育阶段均可以检测到，不受季节和环境限制。
本发明公开了与亚洲棉DPL972纯合光籽性状紧密连锁的分子标记，分子标记有三个，位于8号染色体A08上，分别为命名为分子标记971SV6、分子标记SV6F12R和分子标记SV25LUC，其中分子标记971SV6的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，分子标记SV6F12R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，分子标记SV25LUC的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明找到了鉴定亚洲棉光籽材料的分子标记。可用于纯合光籽性状的分子标记辅助选择以及光籽基因精细定位和图位克隆，为棉花纤维起始研究、纤维品质改良以及棉花遗传育种提供一定的理论依据。
