本发明公开了一种能够为临床给药提供指导且有利于丰富基因多态性研究的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统、方法和应用。该引物系统包括扩增引物对和测序引物,其中,所述扩增引物对的上游引物和下游引物的序列分别如SEQ ID NO1和SEQ ID NO2所示,所述测序引物的序列如SEQ ID NO3所示。本发明的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统、方法采用多重PCR扩增检测位点所在基因片段手,采用荧光标记单碱基延伸技术进行DNP位点检测,在对患者使用伊立替康前检测其体内的UGT1A1*6情况,可以预测依立替康等药物的毒性,并允许选择个体化剂量或替代疗法,为肿瘤患者使用伊立替康及其类似物化疗提供了临床指导。