本发明提供一种乙型肝炎病毒用药指导系统及其应用,并提供了一种引物组,含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的反向引物。并基于上述引物组提供了一种乙型肝炎病毒用药指导,所述乙型肝炎病毒用药指导系统以利用引物组扩增待测样品并结合Sanger测序得到的ab1文件作为输入数据,即可实现氨基酸层面的突变分析,不仅能够基于氨基酸位点的突变分析指导乙肝病毒感染者的核苷酸药物用药,而且还能够发现新的氨基酸突变位点;同时该乙型肝炎病毒耐药突变位点检测模型能够准确高效地对大批量数据进行处理,相较于传统借助比对软件逐一判读,不仅显著提高了判读准确性,还大大缩短了时间。
本发明公开了一种检测脊髓性肌萎缩症相关基因的试剂盒,所述试剂盒含有引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1~18所示的用于检测脊髓性肌萎缩症相关基因的扩增引物组,以及引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:19~27所示的用于检测脊髓性肌萎缩症相关基因的单碱基延伸引物组。其通过单管反应同时检测脊髓性肌萎缩症基因SMN1和SMN2,能够对SMN1和SMN2拷贝数定量,也同时检测中国人群SMA常见的7个热点突变,具有高准确性、高灵敏度、高通量的特点,适合技术推广和应用。利用本发明的引物组合对疑似脊髓性肌萎缩症的患者、确诊脊髓性肌萎缩症的患者、或有脊髓性肌萎缩症家族病史等高危人群,可以对正常人,携带者和患者进行准确的基因分型的目的。
本发明公开了一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测不连续多DNA位点的方法,本方法一对用于重叠延伸PCR的全长扩增的引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~2所示。本发明通过一次PCR将不连续的位点连接成一条DNA片段,对这条包含多个检测位点所在片段,可以一次性进行Sanger测序分析,利用本发明可以将任意的2~4个包含各自检测位点的片段拼接连接形成融合片段,快速、简单,不需要限制性内切酶,中间无任何非目的基因的DNA序列,进而检测的检测突破了Sanger测序读长的限制,可以通过一个Sanger测序反应同时检测多个不连续的DNA位点。