本发明公开一种治疗口腔溃疡的双层膜剂及其制备方法。该治疗口腔溃疡的双层膜剂为双层单向释药膜剂,包括多孔的载药内膜和防水外膜;所述载药内膜包括壳聚糖1‑60份,海藻酸钠1‑37份,聚乙烯醇1‑7份;所述防水外膜包括乙基纤维素、甲基丙烯酸羟乙酯、甲基丙烯酸甲酯共聚物、醋酸羟丙甲纤维素琥珀酸酯中的任意一种单独或多种组合经无水乙醇溶解后制成,浓度为1%~5%。本发明解决了OTC(Over The Count)中成药口腔溃疡散使用不方便,药物容易流失,一次用药作用时间短的问题。此外,本发明还提出了该治疗口腔溃疡的双层膜剂的制备方法。