本发明提供一种外切型硫酸软骨素酶ABC,其DNA序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还提供一种外切型硫酸软骨素酶ABC融合蛋白,该融合蛋白融合有上述外切型硫酸软骨素酶ABC和纯化标签。同时,本发明还提供一种含有上述外切型硫酸软骨素酶ABC的重组载体和转化体。本发明提供的外切型硫酸软骨素酶ABC的DNA序列对大肠杆菌的偏好性达0.97,从而提高了硫酸软骨素酶ABC的DNA序列在大肠杆菌中的表达效率,进而直接降低了外切型硫酸软骨素酶ABC的生产成本。另外,本发明还提供一种上述外切型硫酸软骨素酶ABC的制备方法和应用。