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[发明专利]一种基于深度图卷积网络的计算蛋白质设计方法-CN202310251057.8在审
发明人：张贵军;胡家涛;侯铭桦;周晓根;崔新月;赵鹏鑫 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2023-03-08 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种基于深度图卷积网络的计算蛋白质设计方法，通过GeoVP模块结合图神经网络和卷积神经网络，可利用图神经网络优秀的结构、关系表示能力和卷积神经网络优秀的信息富集能力，将蛋白质的主链原子之间的距离、方位和方向特征以及蛋白质整体的拓扑特征转化为图作为输入，使得由深度图卷积网络构成的生成模型能充分地捕获到氨基酸残基和蛋白质三维结构之间的对应关系。同时，采用有偏温度调整分布采样，结合预测序列先验信息，既简化了采样空间，又能获得比天然的可能性更高的序列；本发明提高了采样效率和采样能力，从而提升预测精度。
一种基于深度图卷网络计算蛋白质设计方法

[发明专利]一种基于多残基间距离图约束的蛋白质结构预测方法-CN202210185769.X在审
发明人：张贵军;金思融;侯铭桦;徐旭瑶;葛锋其;周晓根 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2022-02-28 - 公布日： 2022-05-24 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种基于多残基间距离图约束的蛋白质结构预测方法，首先由trRosetta、RaptorX、LOMETS三个蛋白质残基间距离预测服务器获得三个残基间距离文件以构建三张残基间距离图从来构建基于残基间距离的评分函数；其次循环Rosetta第一、第二阶段以生成初始种群，然后在种群中选择目标构象并对其进行交叉变异以生成测试构象，并通过Rosetta score3概率接收测试构象，以增加种群中构象多样性；然后通过聚类找出符合标准的构象以缩小种群规模，增加算法效率；最后根据三个残基间距离图构建的评分函数来更新种群中的构象，得到最接近天然构象的最优构象。本发明预测效率和预测精度较高。
一种基于残基间距约束蛋白质结构预测方法

[发明专利]一种基于宏基因组的蛋白质多序列比对方法-CN202110433567.8在审
发明人：张贵军;郭赛赛;刘俊;侯铭桦;杨涛;周晓根 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2021-04-20 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种基于宏基因组的蛋白质多序列比对方法，根据目标蛋白的序列，使用HHblits对UniClust30数据库进行初始搜索，过滤掉搜索的MSA中残基空位符超过目标序列长度50％的序列，搜索过程的迭代3次；对获得的多序列比对文件使用hhfilter过滤生成的MSA中gap占比超过25％的序列，得到MSA1；计算MSA1的有效序列数Meff，若Meff≥10L，结束搜索，将MSA1作为多序列比对的输出结果；否则，构建MSA1的隐马尔可夫模型HMM，搜索Metaclust50宏基因组数据库，得到多重序列比对MSA2，将MSA1与MSA2合并，得到最终MSA。本发明不仅增强了搜索同源序列的数量及质量，而且提高了计算效率。
一种基于宏基蛋白质序列方法

[发明专利]一种基于残基接触图信息博弈机制的蛋白质结构预测方法-CN202110440653.1在审
发明人：张贵军;侯铭桦;魏源;彭春祥;杨涛;郭赛赛;周晓根 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2021-04-23 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种基于残基接触图信息博弈机制的蛋白质结构预测方法，首先，通过根据CASP比赛Jaccard指标选择的RaptorX、ResPRE、NeBcon、DeepMetaPSICOV四个蛋白质残基接触服务器，获取多张残基接触图从而构建多个能量函数；其次，利用Rosetta第一、第二阶段对种群初始化，然后通过对目标构象进行变异、交叉生成新的测试构象；最后，根据四个残基接触图构建的能量函数，设计基于Pareto的多目标优化算法来对构象进行更新，从而引导算法采样得到结构更接近天然态的构象。本发明提供一种基于残基接触图信息博弈机制的蛋白质结构预测方法。
一种基于残基接触信息博弈机制蛋白质结构预测方法

[发明专利]一种基于深度残差网络的蛋白质残基间距离分布预测方法-CN202110483806.0在审
发明人：张贵军;杨涛;刘俊;侯铭桦;郭赛赛;冯琼琼;周晓根 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2021-04-30 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种基于深度残差网络的蛋白质残基间距离分布预测方法，首先构建数据集，制作标签数据，获取多序列比对文件，以序列相似度为60％提取多序列比对文件；对20种氨基酸类型和gap进行编码；按照随机分配三张残基接触图权重合成一张新的接触图特征；搭建深度残差神经网络模型，将提取出的特征信息维度规范化处理，合并成一个491维L*L大小的输入特征；输入到深度残差网络模型中，经过数据降维，特征提取和反向传播参数，迭代50次后获得训练模型；将待测的蛋白质序列和特征信息输入到训练的模型中得到残基间的距离在每个距离区间的概率；本发明提供了一种基于深度残差网络的蛋白质残基间距离分布预测方法。
一种基于深度网络蛋白质残基间距分布预测方法

[发明专利]一种基于多种群协同进化的车辆路径优化方法-CN202010849330.3在审
发明人：张贵军;陈驰;武楚雄;杨涛;侯铭桦;刘俊 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2020-08-21 - 公布日： 2020-12-25 - 主分类号： G06Q10/04 文献下载
摘要：一种基于多种群协同进化的车辆路径优化方法，首先，创建研究区域的网络数据集，获取研究对象点之间的距离成本矩阵；然后客户点进行自然数编码，并完成多种群的初始化；对种群中的染色体进行交叉、变异操作，再进行每个子种群间的染色体替换，实现多种群的协同进化，重复交叉、变异和协同进化选择操作，直到满足迭代的终止条件；最终，输出种群中适应度最高的染色体，完成解码操作后，即可得到车辆调度的最优路径方案。本发明提供一种更加贴合实际应用的基于多种群协同进化的车辆路径优化方法。
一种基于多种协同进化车辆路径优化方法

[实用新型]一种基于无线传感器网络的电气设备监测装置-CN201820732092.6有效
发明人： 侯铭桦;许琳琳;顾广龙;王海伦;范陈强 -专利权人：衢州学院
申请日： 2018-05-17 - 公布日： 2018-11-27 - 主分类号： H04W4/38 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种基于无线传感器网络的电气设备监测装置，属于电气设备监测技术领域，包括显示器及与显示器电连接并设置在监测区域内的无线传感器网络，无线传感器网络由与显示器连接的基站及与基站连接的多个无线传感器节点集合而成，无线传感器节点包括能量供应模块、传感器模块、数字信号处理模块和无线网络运行模块。本实用新型将无线传感器网络应用于电气设备运行状态的监测中，减少电气设备在线监测系统的复杂度和有线连接隐患，具有较好的自组织、自适应性，减小单个节点的故障对监测工作的影响。
无线传感器网络电气设备监测显示器无线传感器节点本实用新型电气设备数字信号处理模块能量供应模块在线监测系统传感器模块单个节点基站连接监测区域无线网络运行模块运行状态自适应性电连接复杂度自组织监测基站减小集合应用

[实用新型]一种牙刷支架-CN201720223936.X有效
发明人：刘强;汤剑;羊群;郑天鹏;胡慧峰;侯铭桦;张云平 -专利权人：衢州学院
申请日： 2017-03-08 - 公布日： 2018-03-09 - 主分类号： A47K1/09 文献下载
摘要：本实用新型提供了一种牙刷支架，属于洗漱装置领域。本牙刷支架，包括架体，架体包括支撑体和壳体，支撑体的上表面还开设有一凹槽，壳体具有用于收纳牙膏的腔室，壳体的上、下两端分别开设有与腔室相通的开口一和开口二，壳体开口一处固定有固定环，固定环的上设置有盖体，盖体的上表面竖直开设有用于插设牙刷的放置槽，放置槽的内壁上固定有环形橡胶片，固定环的内壁上固定有安装架，壳体的腔室内具有吸管，吸管与安装架之间设置有能够将壳体腔室内的牙膏挤出来的挤出装置；壳体开口二螺纹连接在支撑体上。本实用新型不仅便于放置牙刷，而且还便于挤出牙膏的优点。
一种牙刷支架

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