本发明提出了一种玉米抗穗腐病的SNP位点、设计引物及其应用,涉及分子生物学技术领域。该位点包括Zm00001d053555基因,Zm00001d053555基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,Zm00001d053555基因的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,其主要解决了现目前有关玉米穗腐病抗性品种及基因缺乏的技术问题。
本发明公开了一种玉米耐低磷相关的Indel标记及应用,该Indel标记位于玉米的第一条染色体ZmPHR1基因的1395bp位置,等位基因为TCTGT的缺失。该Indel标记通过如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物对进行检测。本发明还公开了一种检测玉米耐低磷相关基因ZmPHR1的方法,用上述的引物对进行PCR扩增待检测玉米基因组DNA,如果能够扩增出缺失TCTGT片段,则说明该待检玉米存在耐低磷相关基因ZmPHR1基因。本发明在ZmPHR1序列1395bp位置处插入TCTGT的等位基因型被视作优异/增效等位基因型,此基因型玉米材料在低磷胁迫下的根系表型相对更好。
本发明公开了一种玉米抗虫和/或耐除草剂基因定向表达的基因开关系统及其构建方法和应用。该基因开关系统包括含有抗虫和/或耐除草剂基因的锁定元件,以及如SEQ ID NO.1所示开启锁定元件,并使其在特定组织中表达的核苷酸序列;SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列为位点特异性重组酶基因Cre。本发明利用玉米中内源绿色组织特异型启动子,并结合位点特异性重组系统及相关调控元件,构建玉米基因定向表达“基因开关”技术平台,实现外源基因的精准表达,为培育优质、安全、高效的转基因作物新品系提供强力技术支撑。