本发明公开了一种与大豆谷氨酸相关的KASP标记及其应用,属于分子遗传育种领域。所述KASP标记为S07_6898548和S12_11366121中的一种或多种;所述S07_6898548的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述S12_11366121的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。本发明开发大豆水解谷氨酸和游离谷氨酸相应的KASP标记并进行基因分型,样品基因分型效果明显,可以灵敏、高效、低成本的预测大豆谷氨酸含量,利于筛选培育高氨基酸含量的大豆品种,辅助大豆功能性分子育种,进一步缩短育种进程。