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[发明专利]一种预测分子药物特性的方法及装置-CN202210298949.9在审
发明人：李翛然;陈宇综;易爽;马东强 -专利权人：医图生科（苏州）生命科学技术有限公司
申请日： 2022-03-25 - 公布日： 2022-07-05 - 主分类号： G16C20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种预测分子药物特性的方法及装置，其方法包括：从分子数据库中获取训练分子和所述训练分子的基本信息，并利用所述训练分子的基本信息，得到所述训练分子的高维度特征距离D；通过对所述训练分子的所述高维度特征距离D分别进行降维及网络化处理后，得到所述训练分子的二维特征像素矩阵GMap；获取预测分子的特征计算值向量m，并将所述特征计算值向量m赋予到所述二维特征像素矩阵GMap中，得到所述预测分子的表示二维矩阵MolMap；将所述预测分子的表示二维矩阵MolMap作为所述预测分子的分子表示，并利用所述预测分子的分子表示，预测所述预测分子的药物特性。
一种预测分子药物特性方法装置

[发明专利]一种实现快速筛选氨基酸序列的方法及装置-CN202210278634.8在审
发明人：李翛然;陈宇综;易爽;马东强 -专利权人：医图生科（苏州）生命科学技术有限公司
申请日： 2022-03-21 - 公布日： 2022-07-05 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种实现快速筛选氨基酸序列的方法及装置，其方法包括：将目标氨基酸序列L进行划分处理，得到N个目标子氨基酸序列LN；通过对所述N个目标子氨基酸序列LN分别进行数字转换处理，得到由数字构成的N个独热向量氨基酸序列，并将所述N个独热向量氨基酸序列进行汇总处理，得到目标氨基酸序列矩阵M；利用所述目标氨基酸序列矩阵M，分别计算所述目标氨基酸序列L的组成、转移、分布CTD和序列顺序组合数SOCN；利用所述目标氨基酸序列L的CTD和SOCN，从预置的氨基酸序列库中筛选出与所述目标氨基酸序列L特征相似的氨基酸序列。
一种实现快速筛选氨基酸序列方法装置

[发明专利]肝癌早期诊断试剂或试剂盒及用途-CN201611097323.2有效
发明人：张晶珠;陈宇综;陈少鹏 -专利权人：深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2016-12-02 - 公布日： 2020-08-04 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明提供肝癌早期诊断试剂或试剂盒及用途。具体地，提供UBE2J2、ATP6V0D1和STXBP2中的至少一种作为肝癌早期诊断分子标识物的用途。UBE2J2、ATP6V0D1和STXBP2均在高转移肝癌细胞突出中高表达。多个肝癌及癌旁标本测试证明，它们在大部分的肝癌标本中的表达要比癌旁高。细胞侵袭实验证明，它们能够调控肝癌细胞侵袭能力。因此，它们可作为肝癌诊断和治疗的新靶标，具有潜在的临床应用前景。
肝癌早期诊断试剂试剂盒用途

[发明专利]化合物的3D展示方法和系统-CN201710601316.X有效
发明人： 陈宇综;蒋宇扬;谭英;秦楚 -专利权人：清华大学深圳研究生院;深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2017-07-21 - 公布日： 2020-07-03 - 主分类号： G16C20/80 文献下载
摘要：本发明公开了一种化合物的3D展示方法和系统。该方法可以包括：1)创建化合物属性库，所述化合物属性库存储化合物属性；2)将所述化合物库中化合物多个维度的属性映射到三个维度上；3)创建与步骤2)中的三个维度对应的3D空间，所述3D空间的X轴、Y轴、Z轴分别代表所述三个维度中的一个维度；4)根据化合物在X轴、Y轴、Z轴上所对应的位置，将所述化合物对应的展示体展示在所述3D空间中。本发明将化合物的高维属性特征映射到三个维度上，从而能够直观地向观测者展示化合物属性在化学空间的分布状况，通过研究化合物属性的分布规律，以此评价或预测新的化合物的属性。
化合物展示方法系统

[发明专利]化合物的3D展示方法和系统-CN201710116615.4有效
发明人： 陈宇综;蒋宇扬;谭英;秦楚 -专利权人：清华大学深圳研究生院;深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2017-02-28 - 公布日： 2020-06-16 - 主分类号： G16C20/80 文献下载
摘要：公开了一种化合物的3D展示方法和系统。该方法可以包括：创建化合物库和分子描述符库，所述分子描述符库中的分子描述符表示化合物的性质；创建3D空间，所述3D空间的X轴、Y轴、Z轴分别代表化合物的三种描述方式中的其中一种；根据化合物在X轴、Y轴、Z轴上所对应的位置，将所述化合物对应的展示体以设定的3D形式展示在所述3D空间中。根据本发明的化合物的3D展示方法和系统，直观地向观测者展示化合物群体在化学空间的分布状况，可以通过研究化合物群体的分布规律，应用这些规律来评价或预测新的化合物的属性。
化合物展示方法系统

[发明专利]含替莫唑胺的药物组合物和药物及应用-CN201610809052.2有效
发明人：蒋宇扬;谭英;陈宇综;张存龙 -专利权人：清华大学深圳研究生院;深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2016-09-05 - 公布日： 2019-04-19 - 主分类号： A61K31/4188 文献下载
摘要：本发明涉及一种含替莫唑胺的药物组合物和药物及应用，该药物组合物含有替莫唑胺组份和舍吲哚组份，所述替莫唑胺组份为替莫唑胺或其药学上可接受的盐、酯或溶剂合物，所述舍吲哚组份为舍吲哚或其药学上可接受的盐、酯或溶剂合物；以所述药物组合物的重量为基准，所述替莫唑胺组份的含量为90‑99.99重量％，所述舍吲哚组份的含量为0.01‑10重量％。本发明的药物组合物，毒副作用小，安全性高，可以解决替莫唑胺单独使用存在的安全隐患。同时，联合用药可以增强药物杀伤肿瘤效果，效果明显优于替莫唑胺和舍吲哚单独使用，说明二者在本发明特定配比下配合使用后具有协同增效作用，临床应用前景良好。
替莫唑胺组份药物组合物舍吲哚单独使用溶剂合物可接受协同增效作用安全隐患毒副作用联合用药临床应用杀伤肿瘤配比应用

[发明专利]虚拟筛选化合物在制备激酶抑制剂中的应用和药物-CN201510923390.4有效
发明人：张晶珠;陈宇综;陈上英 -专利权人：深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2015-12-11 - 公布日： 2018-10-16 - 主分类号： A61K31/4162 文献下载
摘要：本发明提供一种虚拟筛选化合物在制备激酶抑制剂中的应用和药物，该虚拟筛选化合物为具有式I、式II、式III或式IV所示结构的化合物或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物。通过体外激酶活性验证，上述化合物对于VEGFR2、FGFR1、HER2、SRC或Braf激酶具有优异的抑制活性。可用于激酶介导的疾病的诊断和治疗。
虚拟筛选化合物制备激酶抑制剂中的应用药物

[发明专利]药物泰尔登的新用途-CN201610089259.7在审
发明人：张晶珠;陈宇综;张巍 -专利权人：深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2016-02-17 - 公布日： 2017-08-25 - 主分类号： A61K31/382 文献下载
摘要：本发明公开了药物泰尔登的新用途。所公开的新用途是泰尔登或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物在下述1)或2)中的应用1)在制备真核生物肿瘤细胞增殖抑制剂中的应用；2)在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用。本发明具有以下优点1)肿瘤药物在临床长期使用中均会出现耐药现象，主要原因之一就是药物的泵出作用，而泰尔登不是糖蛋白的作用底物，可避免药物的泵出，增加疗效；2)临床上使用的大部分激酶抑制剂很难突破血脑屏障，因而对脑瘤很难发挥作用，而泰尔登很容易突破血脑屏障，对脑瘤具有潜在抗肿瘤活性；3)由于泰尔登已经是治疗精神病的上市药物，可大大降低临床前研究中的研究成本，节约资源，缩短研发周期。
药物泰尔登用途

[发明专利]药物氨氯地平的新用途-CN201610089010.6在审
发明人：张晶珠;陈宇综;张巍 -专利权人：深圳市坤健创新药物研究院
申请日： 2016-02-17 - 公布日： 2017-08-25 - 主分类号： A61K31/4422 文献下载
摘要：本发明公开了药物氨氯地平的新用途。所公开的新用途是氨氯地平或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物在下述1)或2)中的应用1)在制备真核生物肿瘤细胞增殖抑制剂中的应用；2)在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用。以氨氯地平作为肿瘤细胞增殖抑制剂或抗肿瘤药物，具有以下两个优点(1)相较于其它肿瘤化学治疗药物，毒副作用低。(2)由于氨氯地平已经是治疗高血压等疾病的上市药物，因此作为肿瘤治疗药物，可以大大降低临床前研究中的研究成本，节约资源、缩短研发周期。实验证明，氨氯地平能有效抑制肿瘤细胞活性，具有潜在的临床应用前景。
药物地平用途

[发明专利]氟哌噻吨的新用途-CN201610809055.6在审
发明人：蒋宇扬;张巍;谭英;陈宇综;谭春燕 -专利权人：清华大学深圳研究生院
申请日： 2016-09-05 - 公布日： 2017-02-01 - 主分类号： A61K31/496 文献下载
摘要：本发明属于药物领域，涉及氟哌噻吨的新用途，具体地，涉及氟哌噻吨或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物在制备真核生物肿瘤细胞增殖抑制剂中的应用，以及氟哌噻吨或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用。氟哌噻吨能通过血脑屏障，有效抑制肿瘤细胞增殖，引发肿瘤细胞死亡，具有潜在的临床应用前景。
氟哌噻吨用途

[发明专利]药物舍吲哚的新用途-CN201110435411.X有效
发明人：蒋宇扬;张存龙;陈宇综;谭春燕;马晓华;辛甜 -专利权人：清华大学深圳研究生院
申请日： 2011-12-22 - 公布日： 2013-06-26 - 主分类号： A61K31/454 文献下载
摘要：本发明公开了一种舍吲哚的新用途。该新用途是舍吲哚或其药学上可接受的盐、酯、溶剂合物在制备真核生物肿瘤细胞增殖抑制剂以及在制备预防和/或治疗肿瘤药物中的应用。肿瘤细胞增殖抑制试验结果表明，舍吲哚对多种肿瘤细胞具有良好的抑制效果，是一种潜在的抗肿瘤药物，具有潜在的临床应用前景。
药物吲哚用途

[发明专利]一种筛选和/或设计针对多靶标的药物的方法-CN201110174760.0有效
发明人：蒋宇扬;陈宇综;马晓华 -专利权人：清华大学深圳研究生院
申请日： 2011-06-27 - 公布日： 2011-10-19 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选和/或设计针对多靶标的药物的方法。本发明方法包括如下步骤：针对k个靶标，分别记作靶标1、靶标2、…、靶标K，搜寻阳性训练集和阴性训练集；分别基于阳性训练集和阴性训练集，得到多靶标特征；基于所述多靶标特征，用SVM法构建目的筛选模型；用所述目的筛选模型判断待筛选物质是否为同时靶向作用于若干个靶标的药物先导物。本发明方法筛选效率高，在药物的开发设计领域具有广阔的应用前景。
一种筛选设计针对靶标药物方法

[发明专利]2-芳基取代苯并咪唑类衍生物及其制备方法与应用-CN201110094836.9有效
发明人：蒋宇扬;李蕴琪;谭春燕;高春梅;刘红霞;陈宇综 -专利权人：清华大学深圳研究生院
申请日： 2011-04-15 - 公布日： 2011-10-19 - 主分类号： C07D235/18 文献下载
摘要：本发明公开了一类具有多靶点蛋白激酶抑制活性的苯并咪唑类化合物及其制备方法与应用。该化合物的结构式如式I所示。本发明提供的化合物经过肿瘤细胞系测试(肝癌细胞)以及多种蛋白激酶测试(VEGFR-2、EGFR、HER-2、PDGFR-α、PDGFR-β等)，证明式I所示化合物是一种潜在的以多种蛋白激酶为靶点的抗肿瘤药物。本发明提供的化合物原料易得，制备方法简单，实验证明其有良好的抗癌效果，在抗肿瘤药物设计研发领域有着良好的应用前景。(式I)
取代苯并咪唑衍生物及其制备方法应用

[发明专利]一类活性化合物在杀灭日本血吸虫中的应用-CN200810037655.0无效
发明人：唐赟;胡薇;邓王平;高振霆;李亦学;陈宇综;曹志伟;孙胜强;冯正;肖树华;张浩冰;徐斌;莫筱瑾;杨忠 -专利权人：华东理工大学;中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所;上海生物信息技术研究中心
申请日： 2008-05-20 - 公布日： 2010-09-01 - 主分类号： A61K31/403 文献下载
摘要：本发明公开了一类可以杀灭日本血吸虫的化合物，其结构如式I所示：其中，R1、R3、R4是氢键受体基团；R2是脂肪烃基团。
一类活性化合物杀灭日本血吸虫中的应用

[发明专利]一种抗日本血吸虫药物作用靶标和药物筛选方法-CN200810037654.6无效
发明人：胡薇;高振霆;李亦学;唐赟;陈宇综;曹志伟;邓王平;孙胜强;徐斌;莫筱瑾;冯正;张浩冰;肖树华;杨忠 -专利权人：中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所;华东理工大学;上海生物信息技术研究中心
申请日： 2008-05-20 - 公布日： 2010-07-14 - 主分类号： G01N33/38 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选治疗和/或预防日本血吸虫感染药物的药物作用靶标，所述的靶标为含有日本血吸虫腺苷酸转运蛋白(SjANT)和二磷酸腺苷(ADP)相互作用的活性位点。本发明还公开了所述靶标的构建方法及其用途。
一种抗日血吸虫药物作用靶标筛选方法

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