本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种丝瓜内参基因UBQ的引物及应用。本发明以内参基因UBQ的核苷酸序列为基础，设计出一对荧光定量特异引物如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2所示。利用BestKeeper，GeNorm，NormFinder和RefFinder分析软件和Delta Ct法对UBQ基因的稳定性进行评价，内参基因UBQ在盐胁迫条件下最稳定。本发明所设计的实时荧光定量PCR引物特异性强，具有很高稳定性、可靠性和重复性，为丝瓜盐胁迫下相关功能基因的精确定量提供有力支持，提高了研究的稳定性、重复性和可靠性。
本发明公开了一套基于美洲南瓜转录组序列开发的SSR引物组及其在鉴定美洲南瓜亲缘关系和遗传特性中的应用，属于分子生物学技术领域。本发明所述SSR引物组有35对引物，其中第1至35对引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.70所示。本发明获得的SSR引物组具有多态性丰富、重复性好、扩增稳定、电泳条带清晰等优点，同时由于这些引物均来自美洲南瓜表达基因，能够反映基因组中功能序列的变异，从而能够更好的区分丝瓜遗传种质的多样性。该引物组可用于美洲南瓜质资源遗传多样性分析、亲缘关系鉴定和DNA指纹图谱构建等领域。
本发明公布了一种甘薯卷叶病毒的RPA检测引物及检测方法和应用，专用于甘薯卷叶病毒特异性分子检测；所述检测引物如下：上游引物F如SEQ ID No:1所示和下游引物R如SEQ ID No:2所示；通过提取感染甘薯卷叶病毒的植株DNA、进行RPA恒温扩增20min，扩增后进行琼脂糖凝胶电泳，产生一条特异性条带。本发明针对甘薯卷叶病毒建立的RPA等温扩增技术具有扩增快速高效、特异性好、操作简便、不需要特殊仪器等优点，为甘薯卷叶病毒早期诊断提供技术依据。
本发明提供一种甘薯薯瘟病菌的RPA检测引物、试剂盒及检测方法，专用于甘薯薯瘟病菌的特异性快速检测，所述RPA检测引物，包括上游引物F，如SEQ ID No:1所示；下游引物R，如SEQ ID No:2所示；试剂盒含有所述RPA检测引物检测用成套核酸；该方法通过提取甘薯薯瘟病菌的DNA、利用试剂盒进行RPA恒温扩增，扩增20min，扩增后进行琼脂糖凝胶电泳，产生一条313bp特异性条带为阳性扩增。本发明具有扩增快速高效、特异性好、操作简便、不需要特殊仪器、无需对样品进行复杂处理、适合现场检测等优点，为甘薯薯瘟病早期诊断提供技术依据。
