本发明公开了一种海洋生物活性肽组合物及其应用,包括通过将蓝藻的功能肽和硅藻门的藻类做生物信息学分析,得到相似度较高的富组氨酸His和半胱氨酸Cys区域,并合成了硅藻生物活性短肽His Tyr Ala Tyr Ala His Ala Cys His Ala Cys Thr Ser Thr Ser Cys Ala Lys Phe Cys Gly Thr,其与维生素C、谷胱甘肽、玉米低聚肽、大豆肽、海参肽、山楂粉、甲壳素、鹰嘴豆粉配合形成组合物,具有降压,抗氧化,抗疲劳,增强免疫力,抗菌的作用,可以应用于保健品,食品或者化妆品。