本发明公开了一种墨兰花器官发育基因CsPI1及其编码蛋白与应用。本发明从墨兰中克隆得到了基因CsPI1,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第93位到725位碱基所示,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。所述的基因CsPI1在拟南芥中过量表达,在长日照下抑制营养生长,促进植物开花,使花期提前;能改变花器官的形态,使花蕾变短圆、表皮无毛或少毛;能改变植物萼片形态,使萼片先端圆润,萼片花瓣状;改变植物花瓣形态,使花瓣先端圆润,呈绽放型;改变角果的形态,使角果由细长型变成短圆柱型。因此,本发明提供的墨兰基因CsPI1在调控植物营养生长、生殖生长和花器官发育方面具有重要的理论及应用价值。