[发明专利]一种地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的液相芯片及其应用

权利要求书

1.一种用于地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的SNP位点组合，其特征在于，包括如下表所示的SNP位点：

2.一种如权利要求1所述的SNP位点组合在制备地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的液相芯片中的应用。

3.一种地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的液相芯片，其特征在于，所述液相芯片包括一种探针组合，所述探针组合用于鉴别权利要求2所述的SNP位点组合中各SNP位点的基因型。

4.一种如权利要求1所述的SNP位点组合或权利要求3所述的液相芯片在地方鸡遗传资源保护或品种鉴定中的应用。

5.一种地方鸡遗传资源保护评价方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)获取待检鸡个体的基因组DNA；

(2)以所述基因组DNA为基础，构建得到测序文库；

(3)所述测序文库与权利要求3所述的液相芯片进行探针杂交反应；

(4)对所述液相芯片捕获的序列测序后的基因型分型信息进行提取，形成基因型分型文件；

(5)根据所述基因型分型文件计算杂合度、核苷酸多态性、分子近交系数、群体有效含量和分化系数，得到评价结果。

6.一种地方鸡品种鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)获取待检鸡群的鸡个体的基因组DNA；

(2)以所述基因组DNA为基础，构建得到测序文库；

(3)所述测序文库与权利要求3所述的液相芯片进行探针杂交反应；

(4)对所述液相芯片捕获的序列测序后的基因型分型信息进行提取，形成基因型分型文件；

(5)根据所述基因型分型文件，以不同分支的其它鸡种为对比，计算所述待检鸡群的基因组分数，当所述待检鸡群的基因组分数大于0.90时，表示所述待检鸡群的纯合度高。