[发明专利]特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其应用

说明书

本发明提供一种特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其在制备诊断或预后工具中的应用，涉及医学诊断标志物及工具技术领域，本申请提供了由5个基因组成的与低氧相关的基因集，包含ASPHD1(Gene ID:253982）、BYSL(Gene ID:705）、CTSE(Gene ID:1510)、FJX1(Gene ID:24147)和GNL3(Gene ID:26354)5个基因，这5个基因的表达水平在特发性肺纤维化患者中显著高于健康人，并且根据这5个基因表达水平计算的评分高的特发性肺纤维化患者生存期显著低于评分低的患者，提示该基因集可应用于辅助特发性肺纤维化患者的诊断和预测预后。

技术领域

本发明涉及医学诊断标志物及工具技术领域，尤其涉及一种特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其应用。

背景技术

正常的肺泡组织被损坏后若修复异常会导致结构异常（疤痕形成），出现以成纤维细胞增殖及大量细胞外基质聚集并伴炎症损伤、组织结构破坏为特征的终末期改变，这一大类肺部疾病被称为肺纤维化。绝大部分肺纤维化患者病因不明，被称为特发性肺纤维化（idiopathic pulmonary fibrosis, IPF），其发病与年龄、性别、遗传、吸烟、环境和职业等因素相关（DOI：10.1016/S0140-6736(17)30866-8；DOI:10.3390/jcm7080201; DOI:10.1056/NEJMra1705751）。IPF被称为“不是癌症的癌症”，近一半患者在确诊后的2-3年内死亡，5年生存率低于30%，且全球IPF患病发病率呈现逐步上升的趋势，而死亡率居高不下，因此关于肺纤维化的研究引起了广泛关注。

肺纤维化患者早期诊断易混淆，且不同肺纤维化患者的疾病进程和对于治疗的反应差异较大，难以预测患者的预后。目前常用性别-年龄-生理指数（Gender-Age-Physiology (GAP) index），包含患者的性别、年龄以及用力肺活量和肺一氧化碳弥散功能指标来预测患者预后，但效果仍不尽人意（DOI:10.3390/jcm7080201; DOI: 10.7326/0003-4819-156-10-201205150-00004）。

发明内容

本发明的目的是为了解决现有技术中GAP指标预测患者预后的效果不尽人意的技术问题 。

为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

一种低氧相关基因表达产物作为分子标志物在制备特发性肺纤维化患者诊断和预后工具中的应用。

优选的，所述低氧相关基因及其编码序列如下：

a. ASPHD1，其Gene ID: 253982；

b. BYSL ，其Gene ID: 705；

c. CTSE ，其Gene ID: 1510；

d. FJX1 ，其Gene ID: 24147 ；

e. GNL3 ，其Gene ID: 26354；

上述5个基因的编码序列包括以下任意一种DNA序列：

（1）序列表中SEQ ID NO.1-5所示的DNA序列；

（2）与（1）限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列；

（3）与（1）或（2）限定的DNA序列具有70％以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA分子。

一种诊断或预后工具，用于对特发性肺纤维化患者诊断和预后，使用上述所述的低氧相关基因中的至少一种作为分子标志物。

优选的，包括通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫组织化学、原位杂交、芯片、高通量测序平台或LC-MS/MS质谱检测所述低氧相关基因的全部基因或部分基因的表达水平以诊断特发性肺纤维化疾病的产品。