[发明专利]用于猪增重速度评估的SNP分子标记、筛选方法和应用

权利要求书

1.一种用于猪增重速度评估的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为猪1号染色体的rs81349297位点。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，当所述SNP分子标记为T，则提示待评估猪的增重速度快，当所述SNP分子标记为C，则提示待评估猪的增重速度慢。

3.根据权利要求2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述增重速度指达115公斤体重日龄。

4.一种用于评估猪增重速度的基因序列，其特征在于，该基因序列包含权利要求1所述SNP分子标记位点的上下游20-100bp的序列片段。

5.根据权利要求4所述的基因序列，其特征在于，所述基因序列如下所示：

TCTTGTTTTTTTTTTAACTTGCAAGAGCTCCTCATTATTGTATATATTGGCCTTTGTCTA(SEQ ID NO:1)-E-CTGAGTCATTGAAAAAACTTACTCTGGAGTTGCTATTGTGGCTCAGCGTAACAAATCCAA(SEQ ID NO:2)，其中E为所述SNP分子标记的位点。

6.一种用于评估猪增重速度的检测试剂盒，其特征在于，包括用于检测权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记的试剂，或包括用于检测权利要求4-5任一项所述的基因序列的试剂。

7.权利要求1-3中任一项所述SNP分子标记的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

获取表型数据：称重，记录日龄，进行第一质控，得到待测猪增重速度的表型数据；

获取SNP分子标记：对所述待测猪取样，提取DNA，基因分型，得到覆盖全基因组的SNP分子标记；对所述覆盖全基因组的SNP分子标记进行物理位置更新，除去预定的SNP分子标记，进行第二质控，对缺失基因型进行填充，进行第三质控；

数据分析：结合所述表型数据，对第二质控后的SNP分子标记进行全基因组关联分析，并分析不同基因型群体猪增重速度差异情况，筛选得到用于评估猪增重速度的SNP分子标记。

8.根据权利要求7所述的筛选方法，其特征在于，所述第一质控包括以下步骤：将所述终测体重＜85kg，或终测体重＞130kg的表型数据去除；

所述第二质控和所述第三质控的质控条件均为：去除SNP检出率99％、最小等位基因频率0.05、哈代-温伯格平衡检验P值小于10-6或个体检出率95％的SNP分子标记数据。

9.一种种猪的选育方法，其特征在于，该选育方法包括以下步骤：检测权利要求1-3中任一项所述的SNP分子标记，或检测权利要求4-5任一项所述的基因序列，当猪1号染色体的rs81349297位点为T时，则判断猪的增重速度快，留用猪。

10.根据权利要求9所述的选育方法，其特征在于，所述留用猪的1号染色体的rs81349297位点的基因型为T/T。