[发明专利]一种长非编码RNA及其在诊断治疗胆管癌中的应用

说明书

本发明属于胆管癌治疗技术领域，公开了一种长非编码RNA及其在诊断治疗胆管癌中的应用，所述长非编码RNA为SNHG15。本发明提供的长非编码RNA的选择方法鉴于长非编码RNA在胆管癌中的重要性，通过对长非编码RNA进行过滤、挖掘，找到了长非编码RNASNHG15，该长非编码RNA在病人的胆管癌中高表达；研究发现长非编码RNASNHG15可以作为胆管癌病人诊断和预后的分子标记物且成为肿瘤治疗的一个靶点；本发明的长非编码RNA在诊断治疗胆管癌中的应用方法简单，能够实现对胆管癌的诊断以及实现对胆管癌治疗药物的筛选，为胆管癌的治疗奠定基础。

技术领域

本发明属于胆管癌治疗技术领域，尤其涉及一种长非编码RNA及其在诊断治疗胆管癌中的应用。

背景技术

目前：胆管癌是胆管的癌症，胆管将胆汁从肝脏排至小肠。最近的证据已表明肝癌可起因自多能肝脏干细胞(Sell和Dunsford Am J.Pathol.134：1347-1363，1989)。胆管癌全世界发生的发病率远远低于肝癌，其在东南亚的发生远远高于欧洲或北美。胆管癌不能通过手术切除来有效治疗，原因在于它的高返回率(return rate)。普通的化学疗法和放射疗法也不可用于胆管癌的治疗(Pederson等，Cancer Res.4325-4332，1997)。另外，胆管癌难于诊断，并且已观察到由于细菌或寄生虫的感染进入胆管引起的慢性炎症有发展成胆管癌的倾向(Roberts等，Gastroenterology 112：269-279，1997)。

尽管有大量的研究结果，但是胆管癌的发病机理仍然未知。用于治疗胆管癌的靶向分子也了解甚少。作为某些细胞遗传研究的结果，仅建立了几个细胞系(Yamaguchi等，J.Nat′l Cancer Inst 75：29-35，1985；Ding等，Br J Caner 67：1007-1010，1993)。但是，现有技术中暂无使用长非编码RNA进行胆管癌的诊断以及治疗的方案。

通过上述分析，现有技术存在的问题及缺陷为：现有技术中暂无使用长非编码RNA进行胆管癌的诊断以及治疗的方案。

发明内容

针对现有技术存在的问题，本发明提供了一种长非编码RNA及其在诊断治疗胆管癌中的应用。

本发明是这样实现的，一种长非编码RNA，所述长非编码RNA为SNHG15，核苷酸序列为SEQ ID NO：1。

本发明的另一目的在于提供一种长非编码RNA的选择方法，所述长非编码RNA的选择方法包括以下步骤：

步骤一，收集长非编码RNA的注释数据，得到长非编码RNA对应的数据集；

步骤二，去除长非编码RNA对应的数据集之间的冗余，得到完备的长非编码RNA数据集；

步骤三，从完备的长非编码RNA数据集中滤除注释数据不一致的长非编码RNA后滤除没有实验证据支持的长非编码RNA，得到过滤后的长非编码RNA数据集；

步骤四，从所述过滤后的长非编码RNA数据集中选取表达量高且位于蛋白质编码基因间区域独立转录的长非编码RNA，作为选定的长非编码RNA；

步骤五，确定选定的长非编码RNA的细胞核与细胞质的定位信息；

步骤六，对长非编码RNA的细胞核与细胞质的定位信息进行分析，选取完全定位在细胞核的长非编码RNA作为目标长非编码RNA，完成长非编码RNA的选择。

进一步，步骤一中，所述注释数据包括长非编码RNA的名称、基因组定位、序列和表达水平。

进一步，步骤二中，所述去除长非编码RNA对应的数据集之间的冗余，包括：利用长非编码RNA对应的数据集间的交叉注释、序列相似性比对和基因组定位的方法去除长非编码RNA数据集之间的冗余。