[发明专利]一种环状RNA测序数据在线交互分析系统

权利要求书

1.一种环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，包括数据过滤模块、序列比对分析模块、环状RNA鉴定模块、样本关系模块、差异分析模块、目标circRNA分析模块、目标来源基因分析模块、RNA集筛选模块、样本分组模块、交互分析模块；

所述数据过滤模块与所述序列比对分析模块连接，所述序列比对分析模块与所述环状RNA鉴定模块连接，所述环状RNA鉴定模块分别与所述差异分析模块、所述目标来源基因分析模块、所述目标circRNA分析模块、所述样本关系模块连接，所述样本分组模块、所述RNA集筛选模块、所述交互分析模块独立存在于系统中。

2.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，还包括数据库注释模块、靶向预测模块、circRNA-miRNA-mRNA关联分析模块，所述数据库注释模块、靶向预测模块、circRNA-miRNA-mRNA关联分析模块依次相连。

3.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述数据过滤模块的具体过滤步骤及标准为：

S1、去除含adapter的reads；

S2、去除含N比例大于10%的reads

S3、去除全部都是A碱基的reads

S4、去除低质量reads，其中，低质量reads为质量值Q≤20的碱基数占整条read的50%。

4.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述序列比对分析模块包括核糖体比对分析和比对参考基因组。

5.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述环状RNA鉴定模块进行环状RNA鉴定并过滤得到高度可信的环状RNA，过滤步骤与条件如下：

S21、breakpoints=1，只保留有且只有1个清晰breakpoint的环状RNA；

S22、anchor_overlap =2，每条Reads的两个Anchors Reads比对到基因组上的位置overlap不能超过2bp；

S23、edit=2，只允许2bp错配；

S24、n_uniq2，uniq Reads大于2条；

S25、best_qual_A35或best_qual_B35，每条Reads的其中一个Anchors Reads比对到基因组上最好的Mapping结果要比其排第二的结果的分值高35分以上；

S26、n_uniqint(samples/2)，支持该环状RNA的uniq reads要大于总样品数的二分之一；

S27、环状RNA的长度小于100k。

6.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述差异分析模块涵盖样本间差异分析和组间差异分析，分析步骤包括：

S31、对readcount进行标准化，即normalization；

S32、根据模型进行假设检验概率的计算，即pvalue的计算；

S33、进行多重假设检验校正，得到FDR值，即错误发现率，并对挑选出的所有差异circRNA的来源基因进行富集分析。

7.根据权利要求1所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述样本分组模块用于接受客户端用户的选择请求，重新按用户选择自定义选择分组方案，用于调整样本信息或重新进行样本分组分析；所述RNA集筛选模块用于接受客户端用户的选择请求，执行新增circRNA集、合并circRNA集、circRNA筛选，以及合并来源基因集、来源基因集筛选来完成筛选基因。

8.根据权利要求7所述的环状RNA测序数据在线交互分析系统，其特征在于，所述交互分析模块可以根据所述样本分组模块和所述RNA集筛选模块接收的客户端请求重置分析参数，实现所述环状RNA鉴定模块、所述差异分析模块、所述差异分析模块的分析内容以及所述目标来源基因分析模块、所述目标来源基因分析模块的分析内容。