[发明专利]预测方法及相关装置、设备在审
申请号: | 202110303541.1 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN113066539A | 公开(公告)日: | 2021-07-02 |
发明(设计)人: | 胡志强;毕研广 | 申请(专利权)人: | 上海商汤智能科技有限公司 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16B40/00;G06N3/08;G06N3/04 |
代理公司: | 深圳市威世博知识产权代理事务所(普通合伙) 44280 | 代理人: | 何倚雯 |
地址: | 200233 上海市徐*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预测 方法 相关 装置 设备 | ||
本申请公开了一种预测方法及相关装置、设备,其中,预测方法包括:获取待测药物的第一原始表示和待测蛋白质的第二原始表示,其中,第一原始表示包括待测药物的分子结构信息,第二原始表示包括待测蛋白质的氨基酸序列信息;对第一原始表示进行第一特征提取,得到待测药物的第一特征表示,并对第二原始表示进行第二特征提取,得到待测蛋白质的第二特征表示;利用第一特征表示对第二特征表示进行互相关处理,得到待测药物和待测蛋白质的最终融合特征表示;基于最终融合特征表示,得到待测药物和待测蛋白质之间的预测反应结果。上述方案,能够提高反应预测效果。
技术领域
本申请涉及信息技术领域,特别是涉及一种预测方法及相关装置、设备。
背景技术
药物研发通常耗时漫长,从实验室合成,到成为市场上批准、流通的药物,往往需要数十年的周期,在此期间更是要消耗大量的资金、人力与物力,成本巨大。
得益于电子信息技术的发展,计算机技术在药物研发过程中发挥着越来越重要的作用。在此过程中,作为药物研发中重要一环的药物靶蛋白反应预测,同样受益于计算机技术,有效地降低了其成本开支。然而,目前采用计算机技术来进行药物靶蛋白预测仍然存在预测效果较差的问题。有鉴于此,如何提高反应预测效果成为亟待解决的问题。
发明内容
本申请提供一种预测方法及相关装置、设备。
本申请第一方面提供了一种预测方法,包括:获取待测药物的第一原始表示和待测蛋白质的第二原始表示,其中,第一原始表示包括待测药物的分子结构信息,第二原始表示包括待测蛋白质的氨基酸序列信息;对第一原始表示进行第一特征提取,得到待测药物的第一特征表示,并对第二原始表示进行第二特征提取,得到待测蛋白质的第二特征表示;利用第一特征表示对第二特征表示进行互相关处理,得到待测药物和待测蛋白质的最终融合特征表示;基于最终融合特征表示,得到待测药物和待测蛋白质之间的预测反应结果。
因此,通过获取待测药物的第一原始表示和待测蛋白质的第二原始表示,且第一原始表示包括待测药物的分子结构信息,第二原始表示包括待测蛋白质的氨基酸序列信息,并对第一原始表示进行第一特征提取,得到待测药物的第一特征表示,以及对第二原始表示进行第二特征提取,得到待测蛋白质的第二特征表示,从而利用第一特征表示对第二特征表示进行互相关处理,得到待测药物和待测蛋白质的最终融合特征表示,并基于最终融合特征表示,得到待测药物和待测蛋白质之间的预测反应结果,由于最终融合特征表示是由待测药物对应的第一特征表示对待测蛋白质对应的第二特征表示进行互相关处理得到的,而互相关处理反应的是两个表示在不同相对位置上的相互匹配程度,故最终融合特征能够反应待测药物的分子与待测蛋白质的肽链等结构在不同相对位置的相互匹配程度,从而通过互相关处理能够模拟待测药物和待测蛋白质的反应机制,进而能够提高反应预测效果。
其中,待测药物的第一特征表示包含对应于不同感受野的多个第一特征表示;利用第一特征表示对第二特征表示进行互相关处理,得到待测药物和待测蛋白质的最终融合特征表示,包括:基于感受野,将多个第一特征表示进行排序;依序选择一个第一特征表示,并利用选择的第一特征表示对第二特征表示进行互相关处理,得到与选择的第一特征表示对应的第一融合特征表示;将选择的第一特征表示对应的第一融合特征表示,作为新的第二特征表示;重复执行依序选择一个第一特征表示的步骤以及后续步骤,直至多个第一特征表示均被选择为止,将基于最后选择的第一特征表示得到的第一融合特征表示,作为最终融合特征表示。
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