[发明专利]鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物及标记方法

说明书

本发明涉及生物技术领域，尤其是一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物及标记方法，其特征在于：该SNP分子标记用于鉴别“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”，该SNP分子标记引物的序列为：正向引物Mogsnp1‑F：AGTGGTGGTTTGAAGTTGGAGT；反向引物：Mogsnp1‑R：GAAGAAGATCATCGACGCAGTT；基于DNA碱基的INDEL（插入/缺失）或SNP位点的特异性对枣品种进行鉴定，为解决内蒙古地区主栽枣品种的识别提供了快速、准确、有效的分子手段，有利于解决该地区枣种质混杂栽培的问题，为该地区枣栽培、经营、管理提供技术依据。本发明的优点是：大大提高了检测速度和效率，并且有效保证检测精度和PCR扩增的稳定性。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其是一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物及标记方法。

背景技术

枣（ZiziphusjujubaMill.）是鼠李科（Rhamnaceae）枣属（Ziziphus Mill.）落叶小乔木，其叶片、果核、果实、树皮、根部、刺儿等可制成药品。枣抗性强、耐贫瘠，喜干燥气候，根系发达，萌蘖能力强，常用于盆景制作、植物配置等园林绿化方面。枣果集观赏、药用、蜜源植物于一身，可食用，亦可药用，含多糖、类黄酮、皂荚等多种生物活性物质，具预防过敏、抗肿瘤、保肝减脂等多种药理功效，兼具生态效益和经济价值。

目前，我国对枣树资源的研究利用已取得较大进展，但仍然存在一些问题，如枣遗传多样性丢失问题、抗病能力差、果实抗裂性差等，与此同时在长期栽培实践中，产生种类繁多的品种及变型，并且生长环境又相似，使其具有相似的形态特征等原因，生产及市场上常有枣品种同物异名或同名异物现象。尤其内蒙古地区最新选育的“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”主栽枣品种，由于其树型、叶型、果型极其相似，难以鉴别，从而在生产实践中常常出现同名异物现象。这严重影响了枣果园的管理、采收和产量。因此，在市场流通时需要准确辨别“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”枣品种，指导枣果园的经营管理，对内蒙古地区枣产业的健康发展具有重要的现实意义。

目前，对内蒙古地区主栽枣品种“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”的鉴定主要通过传统的形态特征鉴别法来完成，而传统鉴定方法需要4-5年的生长周期，并且易受环境的影响，不利于推广。

发明内容

本发明的目的是根据上述现有技术的不足，提供了一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物及标记方法，通过SNP分子标记引物的设计，筛选DNA碱基的INDEL和特异SNP位点的多寡，利用6个特异SNP位点对内蒙古主栽枣品种进行鉴别，大大提高了检测速度和效率，并且有效保证检测精度。

本发明目的实现由以下技术方案完成：

一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物，其特征在于：该SNP分子标记用于鉴别“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”，该SNP分子标记引物的序列为：正向引物Mogsnp1-F：AGTGGTGGTTTGAAGTTGGAGT；反向引物：Mogsnp1-R：GAAGAAGATCATCGACGCAGTT。

一种涉及前述 鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物的分子标记方法，其特征在于：该分子标记方法包括以下步骤：

1）分别采集“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”这三个枣品种的幼叶在零下一定温度进行保存，并通过幼叶提取三个枣品种的总基因组DNA；

以所提取的三个枣品种的总基因组DNA为模板进行所述SNP分子标记引物的PCR扩增反应；

对成功扩增的PCR扩增产物进行纯化、测序，并比对所测序列。