[发明专利]鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物及标记方法有效
申请号: | 202110271567.2 | 申请日: | 2021-03-12 |
公开(公告)号: | CN113234845B | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 哈布尔;王思冉;白玉娥;包文泉 | 申请(专利权)人: | 内蒙古农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海申蒙商标专利代理有限公司 31214 | 代理人: | 周宇凡 |
地址: | 010018 内蒙古自*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴别 内蒙古 地区 主栽枣 品种 snp 分子 标记 引物 方法 | ||
1.一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物的分子标记方法,其特征在于:该分子标记方法包括以下步骤:
1)分别采集“蒙枣1号”、“蒙枣2号”、“蒙枣3号”这三个枣品种的幼叶在零下80℃进行保存,并通过幼叶提取三个枣品种的总基因组DNA;
以所提取的三个枣品种的总基因组DNA为模板利用SNP分子标记引物进行PCR扩增反应;对成功扩增的PCR扩增产物进行纯化、测序,并比对所测序列;当所述序列为:GATACGTTTAAAGCCCCGAAGGCGAAGAAAGCCGGAAAAGATGCTCCGGCGGATCAGGCAATGGGCTAATGGTTGCCATAACCACCATTGCTAtCATCACCACGGATACTGTCATTTTCTTACTCTCtATTTTTTGCTTTTGATTTTCTTATACAACTCCCTTTCTCTAAAATATGGTATCTTTGTGTAGGTGCTTTAATTTTTTTGCAGGAACTTTTTAAAAAAAGGATGTGGTCGGAGTCTAATAATACGGAGCAGCCAAGTCCGGTATCGGTGCTGGATGAGTGAGTGGCAGTAGAGGTACTCCTCCT时,所述枣的品种为“蒙枣1号”;
当所述序列为:CGATACGTTTAAAGCCCCGAAGGCGAAGAAAGCCGGAAAAGATGCTCCGGCGGTCAGGCAATGGGCTAATGGTTGCCATAACCACCATTGCTAtCATCACCACGGATACTGTCATTTTCTTACTCTCtATTTTTTGCTTTTGATTTTCTTATACAACTCCCTTTCTCTAAAATATGGTATCTTTGTGTAGGTGCTTTAATTTTTTTGCAGGAACTTTTTAAAAAAAGGAATGTGGTCGGAGTCTAATAATACGGAGCAGCCAAGTCCGGGAATCgGTGCTGGATGAGTTGAGTGGCAGTAGAGGTACTCCTCCT时,所述枣的品种为“蒙枣2号”;
当所述序列为:CGATACGTTTAAAGCCCCGAAGGCGAAGAAAGCCGGAAAAGATGCTCCGGCGGATCAGGCAATGGGCTAATGGTTGCCATAACCACCATTGCTAtCATCACCACGGATACTGTCATTTTCTTACTCTCtATTTTTTGCTTTTGATTTTCTTATACAACTCCCTTTCTCTAAAATATGGTATCTTTGTGTAGGTGCTTTAATTTTTTTGCAGGAACTTTTTAAAAAAAGGATGTGGTCGGAGTCTAATAATACGGAGCAGCGAAGTCCGGTATCGGTGCTGGATGAGTTGAGTGGCAGTAGAGGTACTCCTCCT时,所述枣的品种为“蒙枣3号”;
所述SNP分子标记引物的序列为:正向引物Mogsnp1-F:AGTGGTGGTTTGAAGTTGGAGT;反向引物:Mogsnp1-R:GAAGAAGATCATCGACGCAGTT。
2.根据权利要求1所述的一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物的分子标记方法,其特征在于:所述PCR扩增反应的体系为20uL的混合体系,由5.5uL的无菌去离子水,1uL的20 ng•uL-1DNA模板,11.5uL的2×Tab Master Mix,1uL所述SNP分子标记引物的正向引物和1uL反向引物组成。
3.根据权利要求1所述的一种鉴别内蒙古地区主栽枣品种的SNP分子标记引物的分子标记方法,其特征在于:所述PCR扩增反应的条件如下:95 ℃预变性3min,30次循环的95 ℃变性30s,53.5℃的退火温度退火30s和72 ℃延伸30s,72 ℃终延伸3min。
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