[发明专利]一种缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记、引物及应用

说明书

本发明属于分子生物学DNA分子标记技术领域，公开了一种缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记、引物及应用，缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记编号分别为：10458F/R、57324F/R、29968F/R、6321F/R、17156F/R、16775F/R、23957F/R、11365F/R、50660F/R、2904F/R、45390F/R、43219F/R、20549F/R、9153F/R、31370F/R和852F/R，所述缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记核苷酸序列分别如SEQ.ID.No.1‑12所示。本发明可用于缺须盆唇鱼的种群遗传多样性和群体遗传结构分析。

技术领域

本发明属于分子生物学DNA分子标记技术领域，尤其涉及一种缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记、引物及应用。

背景技术

目前，缺须盆唇鱼(Placocheilus cryptonemus)，又叫油鱼，隶属鲤科(Cyprinidae)、野鲮亚科(Labeoninae)、盆唇鱼属(Placocheilus)，个体较小，一般体长60～100mm，体近筒形。缺须盆唇鱼为怒江的特有种，近年来，在怒江流域鱼类资源保护的讨论中经常出现缺须盆唇鱼的名字，但对其研究较少，仅限于对其生物学和形态学的少量研究。在2004年的《中国物种红色名录》中已到易危级别，缺须盆唇鱼进行更好的保护是共同亟待研究和探索的问题。

微卫星标记(microsatellite)，又称为短串联重复序列(simple tandemrepeats，STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats，SSR)，由含少数几个(1-6个)碱基对的短串联重复DNA序列组成。鱼类大约每10kbp就出现一次微卫星序列，SSR划分其长度多态性的标准，是根据不同序列、碱基数量和拷贝数之间的差异去判断不同的多态性。微卫星标记已广泛应用于生物的种群遗传结构及多样性评估、物种遗传背景分析和种质资源状况调查中，基于转录组数据的微卫星位点开发，已经为许多鱼类的基因和遗传学研究提供了更多的基础数据，微卫星适于检测种群结构与动态，在分子系统地理学研究中应用广泛。

与其他分子标记相比，SSR分子标记具有共显性、多态性丰富、重复性和稳定性好等优点，且种属特异性强，广泛地分布于整个真核生物基因组中，在模式和非模式生物中均可广泛使用，是现阶段应用最广泛的分子标记技术之一。因此基于转录组测序获取缺须盆唇鱼的SSR分子标记具有经济、可靠的特点，且具有十分重要的应用价值。缺须盆唇鱼是怒江特有的物种，是怒江流域重要的鱼类资源。但近年来其生存环境恶化，资源急剧减少，目前已处于易危状态，亟需大力开展水产种质资源保护工作。本发明根据高通测序得到的数据，开发出缺须盆唇鱼的微卫星标记，同时筛选出缺须盆唇鱼具有多态性的微卫星标记引物，解决了现有技术没有缺须盆唇鱼分子标记的现状，为缺须盆唇鱼的分子标记辅助育种和遗传资源的保护提供新的工具。

发明内容

针对现有技术存在的问题，本发明提供了一种缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记、引物及应用。

本发明是这样实现的，一种缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记，所述缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记编号分别为：10458F/R、57324F/R、29968F/R、6321F/R、17156F/R、16775F/R、23957F/R、11365F/R、50660F/R、2904F/R、45390F/R、43219F/R、20549F/R、9153F/R、31370F/R和852F/R，所述缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记核苷酸序列分别如SEQ.ID.No.1-32所示。

进一步，所述缺须盆唇鱼多态性微卫星分子标记包括；

所述分子标记10458F/R的重复序列为(T)₁₃；

所述分子标记57324F/R的重复序列为(T)₁₂；

所述分子标记29968F/R的重复序列为(AG)₆；