[发明专利]黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法在审
申请号: | 202011453356.2 | 申请日: | 2020-12-11 |
公开(公告)号: | CN112626250A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | 黄飞燕;叶贤文;余磊;刘佳妮;陈泽斌;柯艳果;魏环宇;方宇;王启宇;赵娅红;薛至勤 | 申请(专利权)人: | 昆明学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 昆明合盛知识产权代理事务所(普通合伙) 53210 | 代理人: | 牛林涛 |
地址: | 650000 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病菌 胁迫 烟草 microrna 检测 方法 | ||
1.黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:具体包括以下步骤:
(1)称取烟草茎部样品50mg至液氮中研磨;
(2)加600uL溶解液继续研磨,直至溶解;
(3)转移匀浆至小管,离心力14000Xg,室温条件下离心处理2min;
(4)取上清液,加一倍水相70%乙醇,涡旋混匀;
(5)取600uL含乙醇的水相到柱子上,离心力14000Xg,室温条件下离心处理1min;
(6)去下游液体,加400uL洗液到柱子上,离心力14000Xg,室温条件下离心1min,去下游液体,重复此步骤两次,完成第一次清洗;
(7)配制DNase I混合液:取1uL DNase I稀释至5uL,取1uL稀释液,加入5uL DNase I缓冲,44uL无菌水,用枪头吹打混匀;
(8)步骤(6)第一次清洗之后,在柱子上加入步骤(7)配制好的DNase I混合液,离心力14000Xg,室温条件下离心1min,转移下游液体到柱子上,室温放置15min;加400uL洗液到含DNaseⅠ的柱子上,放置1min,离心力14000Xg,室温条件下离心1min,弃下游液体,重复一次,完成第二次清洗;
(9)离心力14000Xg,室温条件下空离2min;
(10)将柱子转移到提供的1.5mL收集管,加50uL RNA洗脱液到柱子上,离心力200Xg离心2min,室温;离心力14000Xg离心1min,室温;将柱子转个方向,室温,离心力14000Xg离心1min;
(11)检测RNA质量,样本储存于-80℃,长期保存;将提取的RNA样品在冰上融化后,离心并充分混匀,取1uL样品使用无酶水按一定比例稀释后,70℃变性2min,运用安捷伦生物分析仪检测RNA的纯度和完整性。
2.根据权利要求1所述的黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:所述烟草茎部样品采用以下步骤处理获得:
(1)将烟草种子依次进行75%乙醇45s、5%次氯酸钠8min浸泡和无菌水冲洗处理;
(2)播种于育苗棚漂浮盘中,育苗基质采用高温高湿灭菌处理;
(3)待烟草长至8~10片真叶期时,转入昼夜温度分别为30℃和25℃、光暗时间比为12/8,湿度≥70%的人工气候箱中,适应性培养7d;
(4)采用人工茎基部注射接种黑胫病生理小种孢子悬浮液,每株接种5ml,取茎基部以上1cm组织样品1g,对所取样品进行无菌水清洗,然后灭菌纸檫干,迅速用液氮冷冻样品并将其放入-80℃超低温冰箱保存,完成烟草茎部样品的制备。
3.根据权利要求2所述的黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:所述黑胫病生理小种孢子悬浮液采用以下步骤制备:
(1)将分离纯化的烟草黑胫病生理小种在燕麦培养基上培养21d,得到菌丝;
(2)用0.1%KNO3和1%葡萄糖混合液浸泡所述菌丝,并放入26℃恒温箱培养72h,再将其置于8℃冰箱中处理20min取出,室温下10~30min有大量游动孢子释放,过滤,镜检,调整游动孢子的浓度为1×103~1×104个/ml。
4.根据权利要求3所述的黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:所述的燕麦培养基的组份按重量百分数计,包括:燕麦片30g,琼脂粉15g,去离子水1000ml。
5.根据权利要求1所述的黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:所述的检测方法使用联川生物公司提供的TRK1001试剂盒提取抗病材料和感病材料的组织样品RNA。
6.根据权利要求1所述的黑胫病菌胁迫下烟草microRNA检测方法,其特征在于:所述步骤(5)水相较多时,重复操作步骤(5)。
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