[发明专利]ONFH易感相关TNF-α、GREM1、TGF-β、CR2基因SNP检测物质

说明书

本发明涉及ONFH易感相关TNF‑α、GREM1、TGF‑β、CR2基因SNP检测物质。本发明涉及TNF‑α基因单核苷酸多态位点rs1800629(A/G)和GREM1基因单核苷酸多态位点rs11632715(G/A)基因分型，等位基因频率和遗传学模型，TNF‑α基因单核苷酸多态位点rs1800629(A/G)和rs1800630(C/A)、TGF‑β基因单核苷酸多态位点rs8105161(C/T)及CR2基因单核苷酸多态位点rs3813946(T/C)组合之间的交互作用与ONFH发病风险的关联，为建立ONFH的分子水平防治对策提出关键分子靶点，用于ONFH的易感人群筛查及早期干预，促进分子病因学的研究成果与ONFH的临床防治及早对接。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及TNF-α基因单核苷酸多态位点rs1800629(A/G)和rs1800630(C/A)，GREM1基因单核苷酸多态位点rs11632715(G/A)，TGF-β基因单核苷酸多态位点rs8105161(C/T)及CR2基因单核苷酸多态位点rs3813946(T/C)标志物或标志物的组合在制备诊断或辅助诊断、制备评价或辅助评价待测人患ONFH风险性产品中的应用，用于ONFH分子预警、临床分子诊断与分型、药物治疗靶标。

背景技术

股骨头坏死(osteonecrosisofthefemoralhead，ONFH)是由遗传因素与环境因素共同作用引起的复杂性疾病。在近10多年来，ONFH的发病率呈现逐年增加的趋势。据估计在美国年均20000～30000位患者被新诊断为ONFH，在中国每年新增ONFH病例为150000～200000，而且目前中国成年人ONFH患者812万人，主要发病群体为40岁至50岁之间的青壮年，致残率高，导致严重社会与家庭经济负担，是目前人类健康面临主要挑战之一。及早发现ONFH遗传学分子诊断标志物进而实施早期分子预警，使其防治时段前移，是降低ONFH发病率的关键。

近年来ONFH分子发病机理的重要研究进展是陆续提出了多系列基因多态性与ONFH的发病风险相关，它们或者与另外一些基因形成连锁不平衡共同影响ONFH的发病，或者影响其它易感基因的表达功能，在ONFH的发生发展中起协同作用，这些遗传分子病因学研究结果清晰地提示，ONFH属于多个微效基因联合参与并由环境因素诱导的复杂病。例如以下研究：

一、关于TNF-α基因的研究

TNF-α基因染色体位置6p21.33，含有4个外显子，编码蛋白是一种多功能促炎细胞因子，属于肿瘤坏死因子(TNF)超家族。TNF-α主要由巨噬细胞分泌，能与受体TNFRSF1A/TNFR1和TNFRSF1B/TNFBR结合并发挥作用。这种细胞因子参与调节广泛的生物学过程，包括细胞增殖、分化、凋亡、脂质代谢和凝血。TNF-α与多种疾病有关，包括自身免疫性疾病、胰岛素抵抗和癌症。对小鼠的敲除研究也表明了这种细胞因子的神经保护功能。TNFα作为一种参与全身炎症的细胞因子涉及了ONFH的发病过程。但TNFα在ONFH中的确切作用尚不清楚。

一项TNFα对大鼠骨髓间充质干细胞(rMSCs)的研究显示，TNFα可促进细胞增殖和血管生成，从而抑制成骨。DNA甲基化和组蛋白修饰在调节TNFα对成骨分化的影响中起着重要作用。在TNFα处理的rMSCs中，大鼠Runx2启动子的CpG甲基化率增加，坏死组织中TNFα含量明显低于正常组织，TNFα处理的rMSCs中多个Wnt信号通路被TNFα抑制，提示了TNFα对成骨关键信号通路的抑制作用。

遗传流行病学研究已经评估了不同人群中抗炎和促炎症因子基因多态性与ONFH发病风险的关系，但由于不同人群的遗传异质性，结果不均衡。一项来自中国人群的研究关于IL-10、IL-12rs3212227和TNF-α多态性对ONFH的影响，显示TNF-αrs1800629和IL-10rs1800872的基因型和等位基因频率在ONFH患者与正常对照组之间无显著性差异。

二、关于TGF-β1基因的研究