[发明专利]用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组、应用、产品及方法有效
申请号: | 202010596317.1 | 申请日: | 2020-06-28 |
公开(公告)号: | CN111518896B | 公开(公告)日: | 2023-09-26 |
发明(设计)人: | 李萌;夭建华;朱洲海;管莹;陆舍铭;徐玉琼;彭琪媛;唐萍;缪明明;陈章玉;李雪梅 | 申请(专利权)人: | 云南中烟工业有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 昆明正原专利商标代理有限公司 53100 | 代理人: | 金耀生;于洪 |
地址: | 650231 *** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 尼古丁 依赖 相关 snp 引物 应用 产品 方法 | ||
本发明涉及用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组、应用、产品及方法,属于生物技术领域。所述的SNP位点位于人基因组第9号染色体的8561542至9916353区间段,位于PTPRD基因的内含子区间。本发明提供了用于检测这些SNP位点的引物对,以及一种鉴定它们等位基因型的简便方法。同时提供了检测上述SNP位点的试剂在制备用于检测尼古丁依赖易感性的检测制剂或检测装置中的应用。本发明对检测中国人群个体的尼古丁依赖易感性具有重要参考价值,在将来开发预防尼古丁依赖的药物过程中也有广阔的应用前景。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组、应用、产品及方法。
背景技术
吸烟行为不仅与生活环境息息相关,还会受到遗传因素的影响。在遗传上,吸烟行为可能与神经递质系统、代谢酶等多种基因的多态性相关。已有多项研究识别出了多个与吸烟行为相关的基因组区域,这些区域分别位于第3-7、9-11、17、20及22等染色体上。尼古丁作为烟草中存在的一种化学物质,产生尼古丁依赖是影响吸烟者持续吸烟的重要因素。已有研究表明尼古丁依赖受到烟碱乙酰胆碱受体、多巴胺转运体蛋白以及五羟色胺受体等基因的影响。
蛋白质酪氨酸磷酸酶是一种能够调控细胞生长、分化、有丝分裂周期的信号分子。受体型蛋白酪氨酸磷酸酶D(PTPRD)基因对尼古丁依赖的产生有重要影响,例如PTPRD基因上的SNP rs 1975197、rs4626664及rs2381970能够通过改变PTPRD基因的表达进而影响尼古丁依赖的程度。但是,关于PTPRD基因上与尼古丁依赖相关的SNP位点的证据还较少,目前仅有个别SNP有充分的证据支持与尼古丁依赖相关的结论。此外,对如何通过PCR简单高效地获取PTPRD基因上包含与尼古丁依赖相关的SNP位点的序列还没有相关报道。
发明内容
本发明的目的是为了解决现有技术的不足,提供一种用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组、应用、产品及方法。
为实现上述目的,本发明采用的技术方案如下:
用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组,所述的引物组对应的SNP位点为rs71507664、rs35841018、rs115729775、rs77835962、rs35831393、rs71497118、rs71492010、rs76717037、rs12347862、rs1323791、rs10816208、rs10816209、rs10816210、rs10978037、rs10978038、rs10978039、rs1408117、rs1408118、rs10816211、rs10816212、rs10816213、rs10978042、rs10978043、rs12380595、rs72692730、rs10978078、rs72692731、rs72692733、rs72692735和rs72692736;
所述的引物组包括30对引物对,所述引物对如SEQ ID NO.1-60所示的核苷酸序列。
本发明还提供用于检测尼古丁依赖相关的SNP位点的引物组在制备用于检测尼古丁依赖易感性产品中的应用。
本发明提供一种用于检测尼古丁依赖易感性产品,所述产品包括上述的引物组。所述的产品可以为试剂、试剂盒、检测装置等。
进一步,优选的是,所述产品还包括用于检测上述SNP位点的试剂。
本发明另外提供检测多个单核苷酸多态性位点的试剂在制备用于检测尼古丁依赖易感性的检测制剂或检测装置中的应用,所述多个单核苷酸多态性位点包括以下30个单核苷酸多态性位点:
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