[发明专利]一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒有效
申请号: | 201910362343.5 | 申请日: | 2019-04-30 |
公开(公告)号: | CN110004247B | 公开(公告)日: | 2022-04-26 |
发明(设计)人: | 梁琼;杨路路;张燕君;袁芳 | 申请(专利权)人: | 中国科学院武汉植物园 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 黄瑞棠 |
地址: | 430074 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 罂粟 ssr 试剂盒 | ||
1.一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒,包括一套用于检测罂粟及其近缘物种的分子标记;
其特征在于:
所述的一套用于检测罂粟及其近缘物种的分子标记,包括M13公共荧光引物及3个特异性引物对,其引物序列为:
M13:GTAAAACGACGGCCAGT;
P1F:GTAAAACGACGGCCAGTTGGTATCGATCCTTGAAGCC;
P1R:CTCTGCACGATGAAGCTGAC;
P2F:GTAAAACGACGGCCAGTCCTTCGACTAAGGTTCACGC;
P2R:AATCCTCGGCTGAGCTTACA;
P3F:GTAAAACGACGGCCAGTAAAGGGAAAGAAGCTCCGTC;
P3R:CAGGACCTCTCCTTGCAAAA;
区分罂粟及其近缘物种的特异性片段组合分别为:
组合一,包括片段大小为166-168bp、256-258bp和318-320bp的片段;
组合二,包括片段大小为166-168bp、256-258bp和321-323bp的片段;
所述引物分装于试剂盒中,引物对中的引物F与R按摩尔比1:20混合;所述引物F指引物P1F、P2F及P3F;所述引物R指引物P1R、P2R及P3R;所述引物对指P1F与P1R,P2F与P2R,P3F与P3R;所述引物对中的引物对P1、引物对P2和引物对P3按摩尔比2:2:3混合;所述引物对P1包含引物P1F与P1R,引物对P2包含引物P2F与P2R,引物对P3包含引物P3F与P3R;M13公共荧光引物与三个引物对中R引物含量总和的摩尔比为3:5;
所述引物中引物M13标记荧光基团。
2.基于权利要求1所述一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒对罂粟的鉴定方法,其特征在于:
利用所述的3个引物对及M13公共荧光引物,使用Touchdown程序:94℃变性30s,65℃退火30s,72℃延伸30s,进行15个循环,每个循环退火温度降低1℃;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,进行18个循环,72℃延伸10min;对样本DNA进行PCR扩增,按照下列不同长度的特异性片段组合进行罂粟物种的鉴定,罂粟的不同特异性片段组合分别为:
组合一,包含片段大小为166-168bp、256-258bp和318-320bp的片段;
组合二,包括片段大小为166-168bp、256-258bp和321-323bp的片段;
如果与上述所列任一组合片段相符,则待测样本为罂粟;
如果与上述所列组合均不相符,则待测样本不是罂粟。
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