[发明专利]一种与苏淮猪腿臀围性状相关的SNP标记引物对及其应用有效
| 申请号： | 201810971566.7 | 申请日： | 2018-08-24 |
| 公开（公告）号： | CN108998541B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 黄瑞华;刘晨曦;李平华;王彬彬;张倩;兰亭旭;蒲广;王欢;曹旸;高琛;范丽娟;牛培培;张总平;周娟;李强 | 申请（专利权）人： | 南京农业大学;南京农业大学淮安研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人： | 傅婷婷;徐冬涛 |
| 地址： | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 苏淮猪腿 臀围 性状 相关 snp 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种开发与苏淮猪腿臀围性状相关的分子标记的方法，其特征在于以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体rs319699771核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以苏淮猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体rs319699771核苷酸位点转化为分子标记； rs319699771位点三种基因型之间腿臀围性状有极显著差异，其中GG型个体腿臀围显著高于AA型，GG型个体腿臀围高于AG型个体。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物对序列为上游引物：SEQ IDNO.2，下游引物：SEQ ID NO.3。
3.一种检测权利要求1中所述的与苏淮猪腿臀围性状相关的SNP标记的方法，其特征在于包含通过PCR扩增含苏淮猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体rs319699771核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的A/G多态性。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于包括以下步骤：
(1)取苏淮猪组织样品提取总DNA；
(2)用已提取的苏淮猪基因组DNA为模板，使用上游引物为：SEQ ID NO.2，下游引物为：SEQ ID NO.3的引物对进行PCR扩增；
(3)扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在SEQ ID NO.1第92位的A/G多态性。
5.一种用于检测与苏淮猪腿臀围性状相关的SNP标记的引物对在筛选高腿臀围苏淮猪群体中的应用， 所述的引物对的上游引物为：SEQ ID NO.2，下游引物为：SEQ ID NO.3； 所述的SNP标记为国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体rs319699771核苷酸位点，用所述的引物对扩增苏淮猪基因组DNA，扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在SEQ IDNO.1第92位的A/G多态性，从而筛选高腿臀围苏淮猪品系。
6.一种筛选高腿臀围苏淮猪品系的方法，其特征在于包括检测苏淮猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪13号染色体rs319699771核苷酸位点的基因型，选育rs319699771核苷酸位点的GG型个体优先作为种猪。
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