[发明专利]鉴定根肿病菌4号生理小种的特异基因、特异性引物、含有所述引物的试剂盒及其应用有效
申请号: | 201810366659.7 | 申请日: | 2018-04-23 |
公开(公告)号: | CN108315471B | 公开(公告)日: | 2021-11-30 |
发明(设计)人: | 杨辉;郑静;付寅冬;黄云;张煜辉;易春霖 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京君智知识产权代理事务所(普通合伙) 11305 | 代理人: | 黄绿雯 |
地址: | 611130 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 根肿病 生理 特异 基因 特异性 引物 有所 试剂盒 及其 应用 | ||
1.PBRA003268基因在检测根肿病菌(P. brassicae ) 4号生理小种中作为检测靶标的应用,所述基因的序列如SEQ No.1所示。
2.用于检测根肿病菌(P. brassicae ) 4号生理小种的特异性引物对,所述引物对是:
PBRA003268-F:gaataggaaacccgccctgt
PBRA003268-R:cgtgatcgtaccaagacgca。
3.根肿病菌(P. brassicae ) 4号生理小种的检测方法,所述方法包括以下步骤:
(1)待检测样品的制备
通过CTAB法提取待检测样品的DNA,得到含有待检测样品DNA的溶液;
(2)PCR扩增
以步骤(1)的DNA为模板,用权利要求2的特异性引物对PBRA003268-F和PBRA003268-R进行PCR扩增;
(3)凝胶电泳结果判断
对步骤(2)的PCR扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测,当扩增产物大小为248bp时表明检测样品中的DNA中具有根据权利要求1所述的基因PBRA003268,判断该检测样品含有根肿病菌(P. brassicae) 4号生理小种。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于步骤(1)中,待检测样品是提纯的根肿菌休眠孢子,或待检测植株的根瘤。
5.权利要求1的基因PBRA003268在萝卜(Raphanus sativus L.)、油菜(Brassicanapus L.)、芥菜(Brassica juncea (L.) Czern. et Coss.)、甘蓝( Brassica oleraceaL.)、花菜(Brassica oleracea L. var. botrytis L.)或小白菜(Brassica campestrisL. ssp. ChinensisMakino (var. communisTsen et Lee))中检测根肿菌4号生理小种的应用。
6.含有权利要求2所述的特异性引物对的检测试剂盒。
7.用于检测根肿病菌(P. brassicae ) 4号生理小种的基因类型的特异基因的组合,所述特异基因的组合是如SEQ No.1所示的基因PBRA003268、如SEQ No.3所示的基因Novel512和如SEQ No.4所示的基因Novel137。
8.用于检测根肿病菌(P. brassicae ) 4号生理小种的基因类型的特异性引物对,所述引物对是以下三对引物:
用于检测如SEQ No.1所示的PBRA003268的引物:
PBRA003268-F:gaataggaaacccgccctgt
PBRA003268-R:cgtgatcgtaccaagacgca
用于检测如SEQ No.2所示的Novel512的引物:
Novel512-F;gagtgatgagcccgtactgc
Novel512-R:agctgaggggaattccttgg
用于检测如SEQ No.3所示的Novel137的引物:
Novel137-F: acgctggaacgcatagaaca
Novel137-R: catacgggtggatacgggtg。
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