[发明专利]普通小麦SNP位点标记及其在小麦相关性状检测中的应用

说明书

本发明公开了普通小麦SNP位点标记及其在小麦相关性状检测中的应用。本发明提供了检测小麦基因组中Ta‑7A‑SNP354位点单元型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦千粒重、穗长、株高和/或分蘖数性状中的应用。本发明利用分子标记的方法在小麦的7A染色体上找到一个SNP位点Ta‑7A‑SNP354，根据该SNP位点开发出了一个分子标记，在我国小麦微核心种质中利用标记/性状关联分析发现SNP位点与小麦粒重呈极显著相关(P0.01)，与小麦穗长、株高及分蘖数呈显著相关(P0.05)。同时，该标记为共显性标记，重复性好，成本低，在提高小麦粒重的分子标记辅助选择和分子设计育种中具有较好的应用前景。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其涉及普通小麦SNP位点标记及其在小麦相关性状检测中的应用。

背景技术

小麦是世界上主要的粮食作物，寻找与高产相关的功能基因及其分子标记对未来分子育种具有重要的理论意义和应用价值。产量性状大多属于多基因控制的数量性状，表现为连续变异，研究较困难。相对而言，产量构成因子较产量性状遗传力高，且不同生态区域对构成因子的育种要求也不尽相同，因而将产量性状分成独立因子研究更加切实可行。穗数、穗粒数、千粒重、穗长、有效分蘖等均是影响作物产量的农艺性状。利用与小麦产量相关的基因或QTL紧密连锁的分子标记进行辅助选择，可以大幅提高选择效率。在小麦不同染色体上定位了许多产量相关QTLs和相关标记(Cuthbert JL,Somers DJ,Brule-Babel AL,et al.Molecular mapping of quantitative trait loci for yield and yieldcomponents in spring wheat(Triticumaestivum L.).TheorAppl Genet.2008,117:595-608；Maccaferri M,Sanguineti MC,Corneti S,et al.Quantitative trait loci forgrain yield and adaptation of durum wheat(Triticum durumDesf.)across a widerange of water availability.Genetics.2008,178:489-511；Mccartney CA,Somers DJ,Lukow O,et al.QTL analysis of quality traits in the spring wheat cross RL4452×AC Domain.Plant Breeding.2006，125:565-575.)，但已报道的分子标记主要用于基因定位、基因鉴定等研究，用于实际育种的标记非常少，原因主要有：1.现有分子标记大多是基于特定遗传群体和环境互作条件下开发的，在不同遗传背景下是否有效尚待评估；2.小麦基因组很大，标记与功能基因遗传距离较远；3.现有标记主要与抗病性、品质等质量性状相关，可用于实际育种的产量性状标记太少。因此，深入挖掘可用于种质鉴定和育种过程的功能标记具有重要的意义。

发明内容

本发明一个目的是提供检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质的用途。

本发明提供的检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦如下a-e任一性状中的应用：a、株高；b、分蘖数；c、穗长；d、千粒重；e、a-d中任2种或任3种或任4种组合；

所述Ta-7A-SNP354位点为序列5第354位。

上述应用中，所述Ta-7A-SNP354位点的单元型为AA或GG或AG。

本发明还提供了检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质在选育千粒重、穗长、株高和/或分蘖数提高的小麦中的应用。

上述应用中，

所述检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质如下1)或2)：