[发明专利]一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338及应用

说明书

本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体的，涉及一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338，所述SIsv0338标记735bp，位于谷子第五条染色体第42091089‑42091823bp位。该分子标记含有Seq ID No.1所示的序列。本发明还公开了获得上述SIsv0338标记的扩增引物及应用。本发明公开的与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338、扩增引物，可以对谷子株高基因进行良好分型，可以用于谷子株高的分子标记辅助育种，为实现谷子株高的早期鉴定和筛选育种提供分子辅助技术支持，对于加快谷子品种的遗传选育和改良进程具有重要的理论和实践指导意义。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种分子标记，特别是涉及一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在谷子株高基因定位或谷子遗传育种中的用途。

背景技术

谷子是起源于我国的重要粮食作物，也是特色抗旱作物，种子萌发只需要占其重量26％的水分，而高粱、小麦和玉米的种子萌发分别需要其重量的40％、45％和48％的水分，同时谷子对低土壤肥力的忍耐力较高。谷子是环境友好型作物，也是二倍体自花授粉作物，基因组约470M，非常适合作为基因组研究对象。

华大基因早在2009年启动对谷子基因组学研究项目，并于2011年完成了阶段性研究，其成果于2012年5月在国际著名杂志《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上在线发表。谷子基因组序列的组装完成为分子标记开发提供了基础，株高是关系到作物高产和稳产的重要农艺性状，直接关系到品种的株型、抗倒伏性、区域布局。因此，迫切需要发现与谷子株高基因紧密连锁的分子标记。

发明内容

本发明的目的是提供一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338。

本发明的另一目的是提供一种可用于PCR扩增与谷子株高基因紧密连锁的分子标记的引物对，以及由该引物对扩增获得的分子标记。

本发明的再一目的是提供上述分子标记在谷子株高基因定位、检测以及谷子辅助育种中的用途以及上述分子标记的检测方法。

本发明的目的还包括提供一种包括上述分子标记的重组载体，以及含有该重组载体的重组细胞；提供一种包括使用上述分子标记的谷子株高基因的定位方法，和使用所述分子标记的谷子辅助育种方法。

为了实现上述目的，本发明采用了以下技术方案：

本发明公开了一种与谷子株高基因紧密连锁的分子标记SIsv0338，所述SIsv0338标记735bp，位于谷子第五条染色体第42091089-42091823bp位。所述分子标记含有Seq IDNo.1所示序列；优选的其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。其中加下划线部分为引物设计区段：