[发明专利]一种简单高效产生乙型肝炎病毒重组cccDNA的细胞系统在审

专利信息
申请号: 201711285024.6 申请日: 2017-12-07
公开(公告)号: CN109897825A 公开(公告)日: 2019-06-18
发明(设计)人: 袁正宏;邬敏;张小楠;陈捷亮 申请(专利权)人: 复旦大学;上海市公共卫生临床中心
主分类号: C12N5/10 分类号: C12N5/10;C12N15/51
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 细胞系统 乙型肝炎病毒 地高辛标记 动物细胞系 基因组整合 生物学研究 抗HBV药物 转录 蛋白表达 定量检测 特异引物 定量PCR 单拷贝 拷贝数 腺病毒 转座子 可用 位点 整合 转导 微生物 复制 克隆 病毒 筛选 引入 检测
【权利要求书】:

1.一种产生HBV(r)cccDNA的细胞系统,其特征在于,通过下述方法建立HepG2-HBV/loxP细胞系:

①质粒构建:pSBbi-rcccDNA质粒由pSBbi-GP载体质粒(Addgene#60511)插入两端带有loxP位点的HBV单拷贝基因组构建成;pCMV-SB100为Cre重组酶表达质粒(Addgene#34879);

②细胞转染:HepG2细胞以高糖DMEM培养液(含10%胎牛血清,2mM谷氨酰胺)培养,将处于生长对数期的细胞,胰酶消化、计数,按1×106细胞/孔的浓度接种至6孔培养板,培养过夜,待细胞约80-90%融合成片时用于转染,按照每孔转染2μg的量,将1.8μg pSBbi-rcccDNA与0.2μg pCMV-SB100稀释于100μl纯DMEM培养液中,同时将100μl纯DMEM培养液与12μl PEI转染试剂混合,将稀释后的PEI与质粒混和,室温静置20分钟,将混合物均匀滴加入6孔板中,8小时后更换新鲜培养液,继续培养;

③克隆筛选:转染后48小时后,扩大培养至10cm培养皿,待细胞贴壁后加入1μg/ml嘌呤霉素进行筛选,每3天换液一次;4周后,嘌呤霉素抗性单克隆形成,挑取单克隆至96孔培养板扩大培养,每4天传一代,以高糖DMEM培养液(含10%胎牛血清,2mM谷氨酰胺,1μg/ml嘌呤霉素)培养,批量冻存;

④检测HBV基因组整合拷贝数:采用EasyPure Genomic DNA kit(#EE101)抽提基因组DNA,定量PCR试剂采用Thunderbird SYBR qPCR Mix,扩增仪采用StepOnePlus,HBV序列以引物5’-ATGACCGAGTACAAGCCCACGGT-3和5’-TTCGAATCAGGCACCGGGCTT-3’进行扩增,同时扩增19号染色体基因组上相同长度序列作为内参。

2.按权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统,其特征在于,其生物学特性为:

1)利用转座子系统,将两端带有loxP位点的HBV单拷贝基因组整合入HepG2细胞,获得整合有不同拷贝数HBV基因组的克隆株HepG2-HBV/loxP;

2)HepG2-HBV/loxP本身不表达乙肝表面抗原HBsAg,当通过腺病毒载体引入Cre酶后,即生成重组的HBV rcccDNA,并表达HBsAg;HBsAg的表达与rcccDNA的产生和水平密切相关;

3)HepG2-HBV/loxP细胞系中生成的rcccDNA通过设计特异引物利用定量PCR进行定量检测;并且利用地高辛标记系统通过Southern Blot进行检测;

4)rcccDNA的生成快速且稳定,结构特征与真实HBV cccDNA类似,可支持病毒的转录、复制和蛋白表达。

3.按权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统,其特征在于,所述的的细胞系,包含37个克隆株,分别整合有不同拷贝数的HBV基因组。

4.按权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统,其特征在于,所述的细胞系,其建立方法中通过利用转座子系统,将两端带有loxP位点的HBV单拷贝基因组整合入HepG2细胞。

5.按权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统,其特征在于,所述的细胞系,其产生rcccDNA的方法中利用低剂量MOI=2的腺病毒载体转导引入Cre重组酶,对loxP位点进行切割重组产生rcccDNA。

6.权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统在建立HBV cccDNA相关生物学特性研究平台中的应用。

7.权利要求1所述的产生HBV(r)cccDNA的细胞系统在建立筛选、评价抗HBV药物平台中的应用。

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