[发明专利]用于定量图谱分析核酸的方法在审
申请号: | 201711235286.1 | 申请日: | 2017-11-29 |
公开(公告)号: | CN108118084A | 公开(公告)日: | 2018-06-05 |
发明(设计)人: | 詹维康;杨裕雄;陈文逸;林明瑜 | 申请(专利权)人: | 瀚源生医股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837 |
代理公司: | 北京律盟知识产权代理有限责任公司 11287 | 代理人: | 刘媛媛 |
地址: | 中国台湾新竹县竹北*** | 国省代码: | 中国台湾;71 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 标靶 核酸分子群 定量图谱 定量信号 核酸分子 核酸 高灵敏度 图谱分析 应用提供 杂交反应 大数据 景观 构建 标准化 分析 合并 | ||
1.一种建立标靶核酸分子群组的定量景观的方法,其包含:
进行用于定量所述标靶核酸分子群组的每个标靶核酸分子的多种杂交反应以产生多种定量信号;其中所述多种杂交反应具有低于约1fM的定量极限;
产生任何两种定量信号之间的多个比率;和
合并所述比率以用于构建所述标靶核酸分子群组的所述定量景观。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述标靶核酸分子群组中所述标靶核酸分子的数目是n,并且欲相互关联的比率数目是[n×(n-1)/2];其中n是整数。
3.根据权利要求1所述的方法,其缺少标记。
4.根据权利要求1所述的方法,其缺少酶扩增。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述标靶核酸分子选自由以下组成的群组:DNA、cfDNA、甲基化DNA、mRNA、miRNA、LncRNA和核糖体RNA。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述标靶核酸分子群组含有至少三个标靶核酸分子。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述多种杂交反应同时进行。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述标靶核酸分子整合到一个芯片或微阵列中。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述多种定量信号选自由以下组成的群组:电性变化、重量变化、吸收波长变化、吸收强度变化、荧光和荧光强度变化、以及反射率变化。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述电性变化选自由以下组成的群组:电荷变化、电流变化、电阻变化、阈值电压偏移变化、电导率变化、电场变化、电容变化、电流变化、电子变化和电子空穴变化。
11.根据权利要求1所述的方法,其中所述多种杂交反应使用附接到固体表面的识别单链寡核苷酸分子或与所述固体表面隔开一定距离的所述识别单链寡核苷酸分子进行。
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述固体表面是场效应晶体管FET的基于半导体的电感测芯片或表面等离子共振SPR的金属表面。
13.根据权利要求11所述的方法,其中所述固体表面的材料是多晶硅或单晶硅。
14.根据权利要求11所述的方法,其中所述固体表面与检测电性变化的电性变化检测元件耦接。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述电性变化检测元件是场效应晶体管或表面等离子体共振。
16.根据权利要求11所述的方法,其中所述识别单链寡核苷酸分子是包含至少一个电中性核苷酸和至少一个带负电核苷酸的部分中性单链寡核苷酸。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述电中性核苷酸包含被C1-C6烷基取代的磷酸酯基。
18.根据权利要求16所述的方法,其中所述带负电核苷酸包含未被取代的磷酸酯基。
19.根据权利要求16所述的方法,其中所述识别单链寡核苷酸分子附接到固体表面,并且所述部分中性单链寡核苷酸包含附接到所述固体表面的第一部分;所述第一部分的长度是所述部分中性单链寡核苷酸的总长度的约50%;并且所述第一部分包含至少一个电中性核苷酸和至少一个带负电核苷酸。
20.根据权利要求1所述的方法,其中最小与最大定量信号之间的差值为至少两个数量级。
21.一种标靶核酸分子群组的定量景观,其使用根据权利要求1所述的方法建立。
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