[发明专利]检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒和方法在审

专利信息
申请号: 201710187401.6 申请日: 2017-03-27
公开(公告)号: CN106868174A 公开(公告)日: 2017-06-20
发明(设计)人: 李文静;刘赵玲;王淑一 申请(专利权)人: 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司33100 代理人: 黄素萍,徐关寿
地址: 310030 浙江省杭州市西湖区振*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 adamts13 基因 全外显子 试剂盒 方法
【说明书】:

技术领域

发明属生命科学和生物技术领域,特别涉及检测ADAMTS13基因全外显子突变的试剂盒和方法。

背景技术

1924年,Eli Moschcowitz最初详述了血栓性血小板减少性紫癜(thrombotic thrombocytopenicpurpura,TTP),其在临床上主要表现为典型的三联征:即血小板减少,微血管病性溶血性贫血,神经系统损伤;若同时伴有肾脏损害及发热,则形成TTP经典的“五联征”。1997年,慢性复发性TTP患者缓解期血浆中的超大分子量vWF多聚体与vWF裂解酶的缺失之间的联系正式确立。此后,研究者们将这种水解蛋白酶纯化,对先天性TTP家族成员进行了全基因组连锁分析。ADAMTS13基因位于9q34,长度为37kb,包含29个外显子。Zheng等首次对ADAMTS13进行了克隆,并将其列为ADAMTS家族的新成员,称为ADAMTS13。先天性TTP的发病率小于5%,由于严重的ADAMTS13缺乏所致,与ADAMTS13基因突变有关。

现已报道的ADAMTS13突变已经超过140种,包括错义突变、小片段缺失和插入、无义突变以及结合点突变等等。ADAMTS13的基因突变波及整个ADAMTS13蛋白,主要是降低其分泌和(或)酶活性。获得性TTP80%的TTP患者属于获得性TTP,通常由于循环ADAMTS13自身抗体所致。这些抗体能够抑制ADAMTS13蛋白的活性,但是也有10%-15%的患者体内没有抑制性抗体,而是由于增加了抗体调节的ADAMTS13清除率导致ADAMTS13活性严重减低所致。

直接突变检测通过DNA测序仪对ADAMTS13基因直接测序,找出突变的确切位置,可提供更为准确的信息。由于实现了自动化操作,我们采用的PCR结合DNA直接测序方法,因而大大缩短了诊断时间,节省了的人力和物力,测序效率高,能够确定基因突变的位置和形式,结果也更为明确。

多种基因突变检测技术包括蛋白截断试验(PTT)、单链构象多态性(SSCP)、异源双链分析(HA)、变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)等方法,但所有这些方法均有一定的局限性,从而限制了基因突变的检出率。目前常用的基因突变检测的方法是基因测序和荧光定量PCR等。由于ADAMTS13容量大、突变类型多、突变位点散在分布,故而阻止了对ADAMTS13基因突变的深入研究,荧光定量PCR法并不适用。

本发明采用Sanger测序法检测ADAMTS13基因全外显子序列的突变,并且设计的引物可以扩展全外显子序列,通过测序结果的分析,可以很直观的了解ADAMTS13基因全外显子的基因突变情况,并不受ADAMTS13的基因突变多样化以及没有突变热点的影响,并且很大程度的节省了检测成本。

发明内容

本发明提供检测ADAMTS13基因全外显子的引物,采用Sanger测序法,可用于快速检测ADAMTS13基因全外显子突变的情况,用于TTP的基因诊断。

本发明的目的在于提供检测ADAMTS13基因全外显子的引物,包括:扩增覆盖检测ADAMTS13基因全外显子突变的26对正、反向引物;其碱基序列为:

进一步地,引物序列ADAMTS13-1F、ADAMTS13-1R是扩增ADAMTS13基因第1号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-2F、ADAMTS13-3R是扩增ADAMTS13基因第2号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-5-6F、ADAMTS13-5-6R是扩增ADAMTS13基因第5和6号外显子序列的引物,以此类推,引物序列ADAMTS13-17-18F、ADAMTS13-17-18R是扩增ADAMTS13基因第17和18号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-29F、ADAMTS13-29R是扩增ADAMTS13基因第29号外显子序列的引物。

进一步地,所述26对正、反向引物的使用浓度为1:1;

本发明的目的还在于提供一种检测ADAMTS13基因全外显子的方法,其包括如下步骤:

(1)提取样品DNA;

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