[发明专利]一种三方网络资源传播方法在审
申请号: | 201710133230.9 | 申请日: | 2017-03-08 |
公开(公告)号: | CN106934252A | 公开(公告)日: | 2017-07-07 |
发明(设计)人: | 时媛媛;周杰 | 申请(专利权)人: | 华南理工大学 |
主分类号: | G06F19/12 | 分类号: | G06F19/12;G06F19/24 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司44245 | 代理人: | 蔡克永 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 网络资源 传播 方法 | ||
1.一种三方网络资源传播方法,其特征在于包括如下步骤:
将两个二分网络通过共同的中间节点连接,形成一个三方网络,资源在三个节点间不断传递叠加,最后得到初始点和最终节点的权值关系,来预测节点之间相互关联的程度;
三方网络是指将两个网络通过共同的中间节点整合,在新的网络上,资源有方向的传递叠加;叠加传递的过程可看成两个二分传播和最后一个资源整合的过程。
2.根据权利要求1所述三方网络资源传播方法,其特征在于:所述三方网络资源传播方法通过如下步骤实现:
在三方网络的传递模型中,其实是资源在个结点相互转移叠加的过程;为处理好的二分图Nlm=(Vl,Vm,Elm)和Nme=(Vm,Ve,Eme)分别构建邻接矩阵和其中在二分图Nlm中,如果lncRNA和miRNA相互关联,则否则在二分图Nme中也有着相似的定义,如果miRNA与EF相互关联,则否则
三方网络资源传递方法的资源转移的过程,实际是将一个二分图上的投影在三方网络网络上的加权过程,即基于中间miRNA,在lncRNA-miRNA和miRNA-EF网络上单边投影的加权;因此可分成三个部分,即分别计算出miRNA在两个二分网络上的单边投影,以及联合两个投影构成最终的推荐矩阵。过程如下:
在lncRNA‐miRNA关联网络Nlm=(Vl,Vm,Elm)中,资源首先从结点Vm转向Vl,接着资源再传回到结点Vm,这个过程可得到miRNA在Nlm上的资源投影矩阵定义为
其中和表示在二分图Nlm中,miRNAs结点和在向量Vm的度,同样的表示在二分图Nlm中,lncRNA结点在向量Vl的度,nl表示在Nlm中lncRNA的数量,并且参数λ1∈[0,1];
在miRNA-EF关联网络上Nme=(Vm,Ve,Eme),资源的传递从结点Ve开始传递到结点Vm,随后又传回到Ve的过程;最终权值转移矩阵定义为
其中和表示在二分图Nme中,EF结点和在向量Ve的度,同样的表示在二分图Nme中,miRNA结点在向量Vm的度,nm表示在Nme中miRNA的数量,并且参数λ2∈[0,1];
其中参数λ1和λ2用于调节资源传播矩阵的权重;当λ值越接近0,代表结点的资源被计算为邻接结点的平均值,而越接近1,代表资源在领接节点中分布越均匀;在预测中,参数越接近0,预测值更保守,而值接近1,最后的预测结果越趋于整体预测结果;
将上述两步得到的权值矩阵Wm,We与邻接矩阵Ame联合,可以得到权值矩阵将得到了联合权值矩阵后,与二分图Nlm的邻接矩阵Alm再一次联合,最终的预测权值矩阵可以表示为其中ri,j代表lncRNA和EF的关联权重;最终得到的推荐矩阵中,每一个结点都代表lncRNA和EF的关联程度,权值越高二者的关联可能性越大。
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