[发明专利]一种基于扩增矫正的数字PCR检测方法在审
申请号: | 201611200672.2 | 申请日: | 2016-12-22 |
公开(公告)号: | CN107312826A | 公开(公告)日: | 2017-11-03 |
发明(设计)人: | 曹恺;罗海贝 | 申请(专利权)人: | 华东医药(杭州)基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 无锡市汇诚永信专利代理事务所(普通合伙)32260 | 代理人: | 张欢勇 |
地址: | 310051 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 扩增 矫正 数字 pcr 检测 方法 | ||
1.一种基于扩增矫正的数字PCR检测方法,其特征在于,所述方法通过如下步骤实现:
(1)提取待检测者的全血基因组作为血样本模板,然后确定血样本模板的一个单拷贝基因作为待测基因,再确定血样本模板的另一个单拷贝基因作为参比基因,制备两个相同且等量的第一血样本模板和第二血样本模板;
(2)设计合成包含待测基因和参比基因的序列作为载体模板,且载体模板上的待测基因数量等于参比基因的数量,制备两个相同且等量的第一载体模板和第二载体模板;
(3)配置含有第一血样本模板的第一数字PCR反应混合液分散至第一芯片的微反应孔中,第一数字PCR反应混合液包括2×Mix、待测基因引物、第一血样本模板及对应的探针、水、第一载体模板及对应的探针;
(4)配置含有第二血样本模板的第二数字PCR反应混合液分散至第二芯片的微反应孔中作为内参,第二数字PCR反应混合液包括2×Mix、参比基因引物、第二血样本模板及对应的探针、水、第二载体模板及对应的探针;
(5)将第一芯片和第二芯片放在同一反应条件中进行PCR扩增并通过荧光信号读取值,第一芯片中得到待测基因的第一血样本模板拷贝数浓度C1和第一载体模板拷贝数浓度C2,第二芯片中得到参比基因的第二血样本模板拷贝数浓度C3和第二载体模板拷贝数浓度C4;
(6)利用第一芯片中待测基因的第一血样本模板拷贝数浓度C1和第二芯片中参比基因的第二血样本模板拷贝数浓度C3的比值约等于第一芯片中第一载体模板拷贝数浓度C2和第二芯片中第二载体模板拷贝数浓度C4的比值,即约等于1的原理,得出C1矫正后的值为C3×C2÷C4。
2.根据权利要求1所述的基于扩增矫正的数字PCR检测方法,其特征在于所述待测基因为单拷贝致病基因。
3.根据权利要求1所述的基于扩增矫正的数字PCR检测方法,其特征在于所述载体模板是带有待测基因和参比基因的质粒或者DNA片段。
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