[发明专利]一种蜱虫巢式PCR特异性引物及蜱虫巢式PCR鉴定方法有效
申请号: | 201611138265.3 | 申请日: | 2016-12-12 |
公开(公告)号: | CN106755374B | 公开(公告)日: | 2017-12-12 |
发明(设计)人: | 王素华;闫宝龙;帅江冰;吴绍强 | 申请(专利权)人: | 温州出入境检验检疫局综合技术服务中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 温州金瓯专利事务所(普通合伙)33237 | 代理人: | 王坚强 |
地址: | 325000 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 蜱虫巢式 pcr 特异性 引物 鉴定 方法 | ||
1.一种蜱虫巢式PCR特异性引物,其特征在于,包括设计的两对特异性引物,具体为:
T18sF1:5`-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3`;
T18sR1:5`-TCCGCAGGTTCACCTACGGA-3`;
T18sF2:5`-CAARTGTCTGCCYTATCAACT-3`;
T18sR2:5`-CTTCCGTCAATTCCTTTAAG-3`。
2.一种采用权利要求1所述的特异性引物的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将需要检测的蜱虫样品进行形态学上初步分型;
(2)将经过形态学初步分型鉴定处理后的蜱虫样品,每种各取一只,进行基因组提取DNA,蜱虫样品无需RNA酶处理;
(3)以蜱虫样品基因组DNA为模板,以权利要求1中所述的T18sF1+T18sR1为第一套引物,加入LAtaq酶、dNTP、10×Loading buffer、双蒸水,进行第一轮PCR;
(4)以第一轮PCR产物DNA为模板,分别以权利要求1中所述的T18sF1+T18sR2、T18sF2+T18sR1为第二套引物,加入LAtaq酶、dNTP、10×Loading buffer、双蒸水,进行第二轮PCR;
(5)取第二轮PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳鉴定;
(6)将第二轮PCR产物进行序列测定;
(7)根据NCBI数据库中记载的蜱虫18s rRNA基因序列,进行系统进化分析,最终得出蜱虫样品鉴定结果。
3.根据权利要求2所述的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,所述的步骤(3)中的第一轮PCR反应条件为:
95℃预热5min;
94℃保持1min,60℃保持1min,72℃保持2min,该步骤进行共10个循环;
末次延伸至72℃,保持10min,4℃保存10min。
4.根据权利要求2所述的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,所述的步骤(4)中的第二轮PCR反应条件为:
95℃,预热5min;
94℃保持1min,60℃保持1min,72℃保持2min,该步骤进行共25个循环;
末次延伸至72℃,保持10min,4℃保存10min。
5.根据权利要求2所述的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,所述的步骤(3)中蜱虫样品基因组DNA量为2μl,第一套引物中T18sF1+T18sR1各为1μl,LAtaq酶为0.25μl,dNTP为2μl,10×Loadingbuffer为2.5μl,双蒸水16.25μl。
6.根据权利要求2所述的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,所述的步骤(4)中第一轮PCR产物DNA量为1μl,第二套引物T18sF1+T18sR2、T18sF2+T18sR1各为1μl,LAtaq酶为0.25μl,dNTP为2μl,10×Loading buffer为2.5μl,双蒸水17.25μl。
7.根据权利要求2所述的蜱虫巢式PCR鉴定方法,其特征在于,所述的步骤(5)中第二轮PCR产物量为2μl。
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