[发明专利]一种用于特异性检测肠杆菌科细菌的引物、探针及其应用在审
申请号: | 201510368799.4 | 申请日: | 2015-06-29 |
公开(公告)号: | CN105002270A | 公开(公告)日: | 2015-10-28 |
发明(设计)人: | 张贵海;崔溢;王亚卿 | 申请(专利权)人: | 张贵海 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11 |
代理公司: | 北京名华博信知识产权代理有限公司 11453 | 代理人: | 苗源;李冬梅 |
地址: | 050000 河北省石家庄市*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 特异性 检测 杆菌 细菌 引物 探针 及其 应用 | ||
1.一种特异性检测肠杆菌科细菌的引物,其特征在于,所述引物的序列结构如下:
肠杆菌科-F:5′-CTG AAA GCA TCT AAG CAC GAA ACT TG-3′;
肠杆菌科-R:5′-GTC GTC TTC AAC GTT CCT TCA GG-3′;
内部阳性对照-F:5′-TGT GAA ATA CCG CAC AGA TG-3′;
内部阳性对照(IAC)-R:5′-AGC TGG CGT AAT AGC GAA G-3′。
2.一种用于特异性检测阪崎肠杆菌的探针,其特征在于,所述探针的序列结构如下:
肠杆菌科细菌探针:
5′-HEX-AGAGTAGTAGTTGTAGAGGCCGTGCTTCCGAAAG-BHQ-1-3′;内部阳性对照探针:
5′-ROX-TAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCC-BHQ-2-3′。
3.一种用于特异性检测肠杆菌科细菌的试剂盒,其特征在于:包括权利要求11所述的引物及权利要求12所述的探针,以及光敏感性物质。
4.根据权利要求3所述的用于特异性检测肠杆菌科细菌的试剂盒,其特征在于:所述光敏感性物质包括可与DNA的碱基形成共价键的溴化乙锭单叠氮溴(EMA),其浓度为125μg/mL。
5.根据权利要求3或4所述的用于特异性检测肠杆菌科细菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:
内部阳性对照物,所述内部阳性对照物包括pUC19质粒DNA;
DNA聚合酶和尿嘧啶-DNA糖基化酶的混合物;
肠杆菌科细菌的DNA为阳性对照、PCR级水为阴性对照;
缓冲蛋白胨水和DNA提取液;
并选择性的添加可视化的黄色染料。
6.一种特异性检测肠杆菌科细菌的方法,其特征在于,采用如权利要求3-5中任意一项所述的试剂盒,该检测方法包括以下的步骤:
(1)DNA的提取:
取待检样品进行增殖培养、富集,向100μl富集液中加入300μl溴化乙锭单叠氮溴,然后室温暗室培养5min,之后在500W光下曝光5min,离心、除去上清液,再加入DNA提取液,充分混匀、培养、离心,取上清液作为模板DNA;
(2)PCR反应体系:
25μL的反应体系包括18μL所述引物和探针;1μL的所述DNA聚合酶和尿嘧啶-DNA糖基化酶的混合物;1μL内部阳性对照物;5μL模板DNA或阳性对照物或阴性对照物;
(3)PCR反应程序:
在37℃下4min,95℃预变性5min;95℃变性10s,65℃退火延伸70s,40个循环,同时收集FAM,HEX和ROX荧光信号;
(4)结合扩增曲线图判定实验结果。
7.一种用于特异性检测肠杆菌科及阪崎肠杆菌的试剂盒,其特征在于:包括:
阪崎肠杆菌-F:5′-AGG GGA TAT TGT CCC CTG AAA CAG-3′;
阪崎肠杆菌-R:5′-AAA CGA GAA TAA GCC GCG CAT T-3′;
肠杆菌科-F:5′-CTG AAA GCA TCT AAG CAC GAA ACT TG-3′;
肠杆菌科-R:5′-GTC GTC TTC AAC GTT CCT TCA GG-3′;
内部阳性对照-F:5′-TGT GAA ATA CCG CAC AGA TG-3′;
内部阳性对照(IAC)-R:5′-AGC TGG CGT AAT AGC GAA G-3′;
阪崎肠杆菌探针:
5′-HEX-AGAGTAGTAGTTGTAGAGGCCGTGCTTCCGAAAG-BHQ-1-3′;
肠杆菌科探针:
5′-HEX-AGAGTAGTAGTTGTAGAGGCCGTGCTTCCGAAAG-BHQ-1-3′;
内部阳性对照探针:
5′-ROX-TAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCC-BHQ-2-3′;
以及光敏感性物质。
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