[发明专利]组织切片图像的配准的方法、计算机可读介质和图像处理设备有效
申请号: | 201480059940.6 | 申请日: | 2014-10-30 |
公开(公告)号: | CN105659288B | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | J.P.温克;M.B.范里尤文 | 申请(专利权)人: | 皇家飞利浦有限公司 |
主分类号: | G06T7/30 | 分类号: | G06T7/30 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 孙之刚;景军平 |
地址: | 荷兰艾*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 组织 切片 图像 方法 计算机 可读 介质 处理 设备 | ||
一种用于配准组织切片的图像的方法包括:接收第一组织切片(14a)的第一图像(18a)和第二组织切片(14b)的第二图像(18b),两个组织切片从相同组织块(10)准备;确定示出折叠组织(15)的第一图像(14a)中的不可靠区域(27);以及通过配准不可靠区域外部的第一图像和第二图像的区域来配准第一图像(14a)和第二图像。
技术领域
本发明涉及用于组织切片的图像的配准的方法、计算机程序、计算机可读介质和设备。
背景技术
患者材料(组织和细胞)的病理学诊断调查是许多治疗决定的基础,特别是在肿瘤学中。通常,来自活组织检查的薄切片被呈现在显微镜载玻片上并且根据某些协议染色。特定染色剂用于对肿瘤的可能存在类型进行评分和分级。由于应用于单个载玻片的染色剂数目由于视觉光谱中的叠加频率而相当有限(特别地在亮场显微镜中),因此使用连续切片,每一个被不同地染色。在传统病理学中,仅在比喻的意义上将一个载玻片的信息传送至下一个载玻片。多个载玻片之间的快速交替是不可能的,因为其要求切换物理载玻片并且找到感兴趣的区。因此,多个载玻片的配准必须由操作者(例如病理学家)在其头脑中完成。
随着数字扫描仪的引入,图像分析工具可以帮助病理学家配准(连续)载玻片。然而,作为全局配准的一般配准技术可能由于组织中的不同、组织的变形、组织的拉伸等而不工作。诸如局部配准之类的更高级的配准技术不要求单个(全局)变换矩阵并且准许局部适配。
发明内容
另外,配准步骤可能需要对于人为产物是鲁棒的。通常,人为产物(例如染色或成像人为产物)看起来是局部的,使得这些区域例如被省略并且组织幻灯片的图像的其余部分用于配准。然而,该方案在折叠组织的情况中可能不适用。折叠组织不仅影响其中折叠组织可见的局部(空间)区域,而且还导致其它地方的组织的缺失并且潜在地导致组织的一些局部拉伸和变形。
可能存在对于用于关于彼此配准组织切片图像的配准方法的需要,其将局部人工产物考虑在内。
这样的需要可以通过独立权利要求的主题来满足。本发明的另外的实施例从从属权利要求和随附描述显现。
本发明的一方面涉及一种用于配准用于病理学诊断调查的组织切片的图像的方法。例如,组织切片已经从一个组织块准备好。另外,组织切片可以已经被不同地染色。必须要理解的是,术语“配准”可以意味着两个图像(示出类似或相同的内容)全局移动(旋转、缩放和/或移动)和/或局部变形,使得它们的内容尽可能好地叠加。
根据本发明的实施例,方法包括以下步骤:接收第一组织切片的第一图像和第二组织切片的第二图像,两个组织切片从相同的组织块准备;确定示出折叠组织的第一图像中的不可靠区域;以及通过配准不可靠区域外部的第一图像和第二图像的区域来配准第一图像和第二图像以找到感兴趣的区。
必须要理解的是,折叠可以出现在两个图像中。在该情况中,不可靠区域可以在第一图像和第二图像中确定并且两个图像的配准可以基于配准不可靠区域外部的第一图像和第二图像的区域。
例如,可选地不同染色的组织切片(其可以是来自组织块的连续切片)的两个图像通过将具有折叠组织的区/区域考虑在内来局部配准。这些区例如可以通过寻找可能具有阈值以下的像素强度的非常暗的区域(例如具有低像素强度的区域)来确定。可以存储在掩模图像中的这样的不可靠区域或排除区域的内容可以在两个图像的局部配准期间被忽略,这可以增强图像的其余部分的配准。必须要理解的是,不可靠区域可以包含两个图像(即第一和第二图像)中的具有折叠组织的区域。
方法提供鲁棒的配准,其将组织折叠考虑在内。可以减少其中组织折叠的图像的未对准区域。
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