[发明专利]一种快速区分稻曲病菌交配型的分子检测方法有效
申请号: | 201310306977.1 | 申请日: | 2013-07-22 |
公开(公告)号: | CN103436605A | 公开(公告)日: | 2013-12-11 |
发明(设计)人: | 于俊杰;刘永锋;尹小乐;俞咪娜 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 江苏圣典律师事务所 32237 | 代理人: | 孙忠浩 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 区分 病菌 交配 分子 检测 方法 | ||
1.一种快速区分稻曲病菌(Villosiclava virens)交配型的分子检测方法,包括收集待检菌丝和组织样品,采用CTAB法提取所需检测样本的基因组DNA,用0.7%的琼脂糖凝胶电泳进行分析,PCR扩增,使用凝胶成像系统记录电泳结果,利用标记判断DNA片段的大小,其特征在于,检测样本为:稻曲病菌分生孢子单孢菌株或子囊孢子单孢菌株或菌核,所述的PCR扩增为多重PCR扩增,在多重PCR扩增体系中涉及的两对扩增引物是Vm1-F/Vm1-R和Vm2-F/Vm2-R,其中,Vm1-F为SEQ ID NO.1,Vm1-R为SEQ ID NO.2, Vm2-F为SEQ ID NO.3 ,Vm2-R为SEQ ID NO.4。
2.根据权利要求1所述的一种快速区分稻曲病菌交配型的分子检测方法,其特征在于,多重PCR扩增体系为:不含Mg2+的10×PCR Buffer,5uL;浓度为25mM的MgCl2,3μL;dNTP Mixture(2.5mM each),4 μL;浓度为1-5ng/μL的模板DNA,1μL;浓度为10mM的引物Vm1-F和Vm1-R 以及引物Vm2-F和Vm2-R,各1 μL;Taq DNA聚合酶,0.25μL;d2H2O补足至50μL;PCR扩增程序为:94°C,5min;然后依序循环进行94°C,30s;65.4°C,30s;72°C,30s,循环次数为35次;再72°C,5min;4°C保存。
3.根据权利要求1或2所述的一种快速区分稻曲病菌交配型的分子检测方法,其特征在于,MAT1-1交配型稻曲病菌分生孢子单孢菌株、子囊孢子单孢菌株和含有MAT1-1交配型菌丝的菌核可得到180bp左右的DNA条带,MAT1-2交配型稻曲病菌分生孢子单孢菌株、子囊孢子单孢菌株和含有MAT1-2交配型菌丝的菌核可得到280bp左右的DNA条带,据此获得被测稻曲病菌分生孢子单孢菌株、子囊孢子单孢菌株或菌核的交配型;
稻曲病菌MAT1-1和MAT1-2交配型单孢菌株可配合进行有性繁殖;同时含有MAT1-1和MAT1-2交配型菌丝的稻曲病菌菌核可萌发形成子座并产生子囊孢子,为可育菌核;仅含有MAT1-1交配型菌丝的菌核不能萌发产生子座,为不可育菌核。
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