[发明专利]新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用

权利要求书

1.一种分离的短串联重复序列基因座G5S0003，其特征在于，所述基因座的序列如SEQ ID NO.:1所示。

2.一种分离的核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列的结构如下：

X1-X2-X3

式中，X1为SEQ ID NO.:2中第1-800位；

X2为含有≥10个重复单元atag和/或atga和/或taga和/或tata和/或gata的遗传多态区，并且X2的长度为50-150bp，并且遗传多态区是SEQ ID NO.: 1所示的多核苷酸,或者遗传多态区是在SEQ ID NO.: 1基础上缺失或插入一个或几个重复单元而形成的多核苷酸，所述重复单元为atag和/或atga和/或taga和/或tata和/或gata；

X3为SEQ ID NO.:2中第925-1664位。

3.如权利要求1所述的短串联重复序列基因座G5S0003的用途，其特征在于，用于制备：

(a) 用于遗传关系分析的试剂或试剂盒；

(b) 用于个体识别的试剂或试剂盒；

(c) 用于亲子鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒；

(d) 用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或

(e) 用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。

4.如权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的试剂包括(i)引物或引物对；(ii) 探针；(iii) 核酸芯片。

5.如权利要求4所述的用途，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示。

6.一种特异性扩增短串联重复序列基因座G5S0003的引物对，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示，所述基因座G5S0003的序列如SEQ ID NO.:1所示。

7.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括：

(a) 用于特异性扩增短串联重复序列基因座G5S0003的引物对，所述引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示，所述基因座G5S0003的序列如SEQ ID NO.:1所示；

(b) 使用说明书。

8.如权利要求7所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括(c)特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。

9.一种扩增体系，其特征在于，所述扩增体系包括：

(a) 用于特异性扩增短串联重复序列基因座G5S0003的引物对，所述引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示，所述基因座G5S0003的序列如SEQ ID NO.:1所示；和

(b) 任选的、特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；

并且所述引物对(a)和任选的引物对(b)位于同一扩增体系。

10.如权利要求9所述的扩增体系，其特征在于，所述的扩增体系为复合扩增体系，其中，所述的引物对(b)包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，或16对特异性引物对；和/或

所述复合扩增体系为荧光标记的复合扩增体系，其中，所述荧光标记是指选用下组的一种或多种荧光标记试剂标记所述基因座的引物：FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD-700/800、CY3、CY5、CY3.5、CY5.5、TET、TAMRA、JOE、BODIPY TMR、俄勒冈绿、罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。