[发明专利]基于蛋白质交互作用网络的异病同治分子机理分析方法

权利要求书

1.一种异病同治分子机理分析方法，用于分析同治药物实现异病同治的分子机理，所述同治药物是指可以同时治疗多个疾病的药物，其特征在于，包括如下步骤：

S1、构建至少两种疾病各自的蛋白质交互作用网络；

S2、根据所述同治药物的化合物成分预测该同治药物中各化合物的潜在靶标，保留与所述疾病相关的基因对应靶标的化合物；

S3、根据所述同治药物的化合物成分的潜在靶标在每一疾病的蛋白质交互作用网络中的分布对同治药物中各化合物进行聚类；

S4、在所述聚类中的每个类簇中确定频繁出现的靶标组合；

S5、对所述疾病的蛋白质交互作用网络中频繁出现的靶标对应的节点进行对比分析，以得到该同治药物对所述至少两种疾病实现异病同治的分子机理。

2.如权利要求1所述的异病同治分子机理分析方法，其特征在于，所述步骤S2进一步包括对所述同治药物的化合物成分的筛选步骤：如果所述化合物的潜在靶标中没有一个和所述疾病的基因相关，则将其筛除，否则保留该化合物。

3.如权利要求1所述的异病同治分子机理分析方法，其特征在于，所述步骤S3中的聚类是针对化合物之间潜在靶标在所述疾病相关的蛋白质交互作用网络上的距离对化合物进行聚类分析。

4.如权利要求3所述的异病同治分子机理分析方法，其特征在于，所述距离的具体定义如下：

distanceij=1(|Gi∩Gj|/max(|Gi|,|Gj|)+Σm∈Gi,n∈Gj1/dmn)·|Gi|·|Gj|]]>

其中distance_ij表示两个化合物i，j之间的距离，G_i，G_j分别表示化合物i，j对应的靶标集合，||表示取集合的长度，max(|G_i|，|G_j|)表示集合G_i，G_j中最大的长度，m，n表示集合G_i，G_j中的靶标；d_mn表示两个靶标在蛋白质交互作用网络中的距离，利用最短路径来表示两个节点在蛋白质交互作用网络中的距离。

5.如权利要求1所述的异病同治分子机理分析方法，其特征在于，所述步骤S4包括：利用Apriori算法找到频繁的靶标组合，从分子层面上找出该同治药物的主要成分所共同作用的靶标组合。