[发明专利]检测OTOF基因c.1671_1673delG突变的试剂盒有效

专利信息
申请号: 201210172364.9 申请日: 2012-05-29
公开(公告)号: CN102787163A 公开(公告)日: 2012-11-21
发明(设计)人: 王秋菊 申请(专利权)人: 王秋菊;中国人民解放军总医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 代理人: 黄韧敏
地址: 100853*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 otof 基因 1671 _1673delg 突变 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用于检测与感音神经性聋及听神经病/听神经病谱系障碍相关的位于OTOF基因的c.1671_1673delG(X579)突变的试剂盒,所述试剂盒包括:

从待测样品中提取DNA的试剂;

用于扩增样本DNA的PCR反应试剂;

对PCR扩增产物进行测序的试剂;

其中,所述扩增样本DNA的PCR反应试剂包括PCR引物,所述PCR引物扩增的目标片段包含OTOF基因第1671-1673位碱基。

2.如权利要求1所述试剂盒,其中所述PCR引物为选自下述引物中的一对:

OTOF-F-1:5’-CTGAATGGCACACATGAAGTTCT-3’,

OTOF-R-1:5’-GCCTTATCCTGAGGTATGACTCC-3’;

OTOF-F-2:5’-CTCCACCCCAGCGCAGTGT-3’,

OTOF-R-2:5’-CCTGGGGGACAGCACAGTG-3’;

OTOF-F-3:5’-CCAGGAAGCAGGGAGCTAGA-3’,

OTOF-R-3:5’-CCCAGGTGACTCAGGGAGAA-3’;

OTOF-F-4:5’-GGAAGAAATAGACCCAAGAGAG-3’,

OTOF-R-4:5’-GACGAGGGCAGAGTCCTGT-3’。

3.如权利要求1或2所述试剂盒,所述试剂盒用于检测位于OTOF基因的c.1671_1673delG(X579)突变的方法,包括以下步骤:

1)采集待测个体的血液、体液或组织样本,提取DNA;

2)以该DNA为模板,以下列PCR引物进行PCR反应,得到PCR反应产物;

其中,所述PCR引物扩增的目标片段包含OTOF基因第1671-1673位碱基;

3)将得到的PCR反应产物进行直接测序,并将测序结果与OTOF正常基因的序列进行比较,确定是否存在OTOF基因的c.1671_1673delG突变位点。

4.如权利要求3所述试剂盒,所述方法还进一步包括下述步骤:

4)按照正常阅读框架进行翻译以确定c.1671_1673delG突变使氨基酸序列自558位发生移码改变,并使氨基酸的编码提前终止于第579位的氨基酸(p.G558A fsx21)。

5.如权利要求1所述的试剂盒在用于检测感音神经性聋及听神经病/听神经病谱系障碍中的用途。

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