[发明专利]核酸以及鉴定真菌菌株致病型的方法和试剂盒有效
| 申请号： | 201210052313.2 | 申请日： | 2012-03-01 |
| 公开（公告）号： | CN103243093A | 公开（公告）日： | 2013-08-14 |
| 发明（设计）人： | 戴小枫;陈相永;李蕾;柳少燕;王金龙;陈捷胤;田李 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人： | 王浩然;王凤桐 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 核酸 以及 鉴定 真菌 菌株 致病 方法 试剂盒 | ||
1.一种核酸，该核酸具有SEQ ID NO：1所示的序列，或者具有SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列，并且所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列在大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)的全基因组序列范围内仅存在于SEQ ID NO：1所示的序列中。
2.根据权利要求1所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为100-5000bp。
3.根据权利要求2所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为100-1000bp。
4.根据权利要求3所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为100-500bp，优选为150-250bp。
5.根据权利要求1所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为15-99bp。
6.根据权利要求5所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为18-50bp。
7.根据权利要求6所述的核酸，其中，所述SEQ ID NO：1所示的序列中的特异性序列的长度为20-40bp，优选为22-35bp。
8.一种核酸，该核酸与权利要求1-7中任意一项所述的核酸互补。
9.一种鉴定真菌菌株致病型的方法，所述真菌菌株为大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)，该方法包括以下步骤：
(1)制备含有大丽轮枝菌的全基因组DNA的待测样本；
(2)检测所述待测样本中是否存在第一分子标记，所述第一分子标记为根据权利要求1-8中任意一项所述的核酸；
(3)根据步骤(2)的检测结果判断大丽轮枝菌菌株的致病型，在所述待测样本中不存在所述第一分子标记的情况下，则指示所述大丽轮枝菌的菌株不属于高致病型；在所述待测样本中存在具有SEQ ID NO：1所示的序列的核酸或它的互补核酸的情况下，则指示该大丽轮枝菌的菌株属于高致病型。
10.一种试剂盒，所述试剂盒含有根据权利要求8所述的核酸，以及PCR试剂和/或分子杂交试剂。
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