[发明专利]鼠伤寒沙门氏菌的特异性FQ-PCR检测方法有效
申请号: | 201210045529.6 | 申请日: | 2012-02-21 |
公开(公告)号: | CN102618635A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 程安春;黄静玮;汪铭书;陈孝跃 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;G01N21/64 |
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地址: | 611130 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 伤寒 沙门氏菌 特异性 fq pcr 检测 方法 | ||
1.一种鼠伤寒沙门氏菌的特异性FQ-PCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一,筛选出鼠伤寒沙门氏菌全基因组DNA中的保守且特异性的STM4493基因,其核苷酸序列由SEQ ID NO:1定义,并根据其序列设计扩增引物对和探针;引物对和探针序列如下:
上游引物:5-’CCGCGTTTTTGTATTGAAAGTTATC-3’(SEQ ID NO:2)
下游引物:5-’AAACATCATGAACGGCCTGG-3’(SEQ ID NO:3)
探针:5-’CAGCCAAAACATCAGCAGGCGATCA-3’(SEQ ID NO:4)
步骤二,提取样品DNA;
步骤三,对样品DNA进行FQ-PCR检测;FQ-PCR反应体系如下:依次加入10×PCR反应缓冲液2.5μL,25mmol/L的Mg2+2.0μL,2.5mmol/L的dNTP1.0μL,5μM引物对1μL,5μM探针0.5μL,Taq酶1U,模板溶液0.5~2μL,最后用双蒸水补至25μL;扩增参数具体为:95℃预变性5min;之后开始扩增循环,每个循环的程序为:95℃变性30s,51℃退火30s,72℃延伸30s;共45个循环;最后72℃延伸10min,降温至16℃,结束;
步骤四,通过FQ-PCR仪自带软件自动分析读取FQ-PCR检测结果,判断样品是否含鼠伤寒沙门氏菌;所述判断具体为:若出现Ct<35且呈对数增长的特异性扩增曲线,则说明样品中含鼠伤寒沙门氏菌;若未出现Ct<35且呈对数增长的特异性扩增曲线,则说明样品中不含鼠伤寒沙门氏菌。
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