本发明涉及一种来源于超嗜热古菌的酰胺酶及其编码基因与应用,所述酰胺酶为如下(a)或(b)的蛋白质:(a)由如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列经过取代、缺失或者添加一个或几个氨基酸且具有酰胺酶活性的由(a)衍生的蛋白质。所述酰胺酶的应用为分别以乙酰胺、丙烯酰胺、L-谷氨酰胺、己酰胺和L-天冬酰胺为底物,进行转化反应相应制备得到乙酸、丙烯酸、L-谷氨酸、己酸和L-天冬氨酸。所述编码基因在制备重组酰胺酶中的应用。本发明提供的酰胺酶能高效转化脂肪族酰胺类物质,具有工业化生产潜力和经济价值。