本发明提供一种用于鉴定砗磲DNA条形码组合,包含有用于鉴定砗豪的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1、用于鉴定无磷砗磲的DNA条形码,其核苷酸序列其核苷酸序列为SEQ ID NO:2、用于鉴定大砗磲的DNA条形码,核苷酸序列为SEQ ID NO:3、用于鉴定长砗磲的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQ ID NO:4、用于鉴定磷砗磲的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQ ID NO:5、用于鉴定番红砗磲的本发明再一个方面提供扩增上述砗磲科贝类DNA条形码的通用引物对,其引物的序列为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。本发明的条形码和扩增引物可以有效的鉴定砗磲的具体种类。